找回密码
 立即注册

QQ登录

只需一步,快速开始

搜索
热搜: 活动 交友 discuz
查看: 3617|回复: 4

如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

[复制链接]

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术

* N3 k: t: w. u# t8 c+ W. g
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
4 P0 m9 N: K  G/ J
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

+ L3 w! a( |0 A8 Y5 j% u, g  f
——正式开始——

7 @! [8 D: u- l5 l
1. 折线图
( q7 V, S" H% n; R  ~$ S/ ^
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
- a' ^- k" V: Q$ k
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

# x) p% ?$ i# k% v" R6 O
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

- L" U& N* [3 p% M* J9 v" g# _" |
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
5 l2 m, b6 r7 j, K1 @" T* n
6 o# j* Q7 e4 G# P! Q

) D& U! z4 v3 z$ x
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

1 E- m0 N) `$ Y  c' D
# Y& W" F; l' W2 a  ?1 J+ Q

7 b  [2 M- T2 H1 B( g8 C3 H
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
" c, W# y: m5 k3 f( p

2 o$ a9 y1 a4 k7 z
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

2 M, H' _! j  g3 y8 M7 v7 }1 ~( w6 h
" ?' m* O. i' p' b' N9 `

$ l( ]; y$ m5 ]/ z! Z' q* |
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

7 }: R# `; D1 d, }- G: s8 y$ ?
8 n) \3 X: [( P, f' s/ |/ }7 z+ o/ a
& T" p3 L/ V) L6 U$ k& X) x
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

: Z. V3 Q9 y" G, _' R

( k- d( r8 a8 j3 j5 @3 t, Z2 x

' ]: E' q6 n& N+ a9 s
  在Data栏中输入数据

" U! P  W8 r$ ^& i- P

; g, I' K' {' ^: y
# s9 N6 g( @$ O% S/ `
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
; d; ]6 ]5 H: t/ q) g& Q; ^! }! x2 R

& t; c8 w  s! `9 ?' g0 U" T5 ^: h
/ R3 T  T* A$ w0 t
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

! ~: h1 r3 E5 @5 P$ j4 y1 Z. }/ n
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
" ?) [- a% e9 r" W) O7 q7 ~4 z( W
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
# ~- Q1 V2 x1 x4 r. S
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

" z+ H, f2 T! F: `' F; `. v
$ x; E8 k1 f: o
6 e" J$ {/ s0 o9 Y, J! {
在data栏中粘贴数据,如下图

8 b5 x4 N8 z( Z( [4 S" z5 K* B

, T8 B: j+ W6 M1 v

( O! i+ q6 ^0 m7 A
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

* ]7 _& r# w: y% L$ ]% O
: B2 I' M" x6 w( {4 d" r5 N5 w/ z. m3 P6 d
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

9 z8 f6 R/ q( u% `1 T7 e. ?
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
+ V9 T# c- t* b: T

2 I9 t+ C7 S; x, U3 Y
, z2 `4 ]6 Q! C3 N* {" P% V, a
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

, X: `% l4 p& s' r+ s

, y, m/ ^7 x: Z' V. ~

! i! a, }( o( T- @( L* ], ~! L1 w
  将数据粘贴进去
7 m" Z# u& U9 E

1 x: p" ~% ^" j/ C
+ X; W- O0 t; p6 V% T+ S
  软件即时生成的图如下图所示:
, W& A7 m# m% T* Z' G) l$ X

; a6 c$ ?) @3 A* P/ u
3 h' p, b: k' N: d4 Q% @
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
5 i$ N2 Q+ p! n7 s( E7 ?
2. 柱状图
$ p3 F% p. v/ h0 K
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
+ Z- g3 T" `3 a/ f1 X5 ~
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
5 z$ G4 G  Q3 d* ^. A8 }
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
, B' ~1 H- ]7 m4 O1 [
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

4 q& a' y- ~" b0 d; a, s3 v3 ?
4 O) R9 @4 x8 f6 i9 g1 m

* L8 ~6 T5 f: X, e4 `
在Data分栏中输入以下数据

* C+ i; r8 J$ P' F$ m6 M
9 A% Q7 ]4 B. j1 I+ [

- _1 r4 n8 _1 R
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

' F% d9 j- S- _3 E
( d( E1 K4 D+ ~' B7 n; X8 n
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

7 a" l  ^  X& N+ `: ?0 X; V
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
3 b- u, C4 K, I6 |: T
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
8 \: h. }! s( R$ M( y/ z
- p# _& s; y. A5 S; r" r$ o9 w5 v
9 X- ]# r, d9 T5 _8 B6 e/ ^; K0 x
  在Data分栏中输入以下数据
/ J4 F$ Z- R( E0 f9 N# U
( ^) d# r4 Q% I* C0 e

7 @/ L. `0 r# B1 `- a3 b1 ~
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
+ U% N. J, c5 v

2 d" X* y, \& |0 F3 w- d# I. N
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
2 Y8 d4 r; H6 z) @6 ?
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

* _4 I$ o3 B, W* m: F  z
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
0 ~$ F, C# L( Z; W, [0 @$ P3 y
1 M. \+ g& f8 ~1 }
# N7 _0 h( N/ {+ W8 F7 n4 [1 V
  软件及时生成柱状图,如下图
4 k9 \5 T0 F. I
; a" ?4 p  Q  U; Z5 y
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
2 p' f) M/ B* `2 g' [; q+ o
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

! ~9 h6 U$ T( z3 k, k. ^
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
1 N# j/ p! @8 F8 n* h' m. ~8 W/ a
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
, v7 ?# ]+ C1 S4 g% [$ o2 V

, D) t; j  O3 M4 d# J
2 D" o/ L; W  q! Z% t( ?, H
在data栏中输入数据

* G) `6 `& A3 G
4 Y9 Q& p+ o5 v; n

- q: S" ]/ u7 C9 u! H( i  ~3 K
软件即时生成的图如下图

: o5 n" g% A. r0 E$ Z- m) Z6 W) l

7 v" I9 i9 ]$ j

9 ]3 P9 Y, s( f- {; A8 X; w% F
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

3 M' q* V" d% _# W& U4 A# Q
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

6 Y, O* M6 B' G% m8 H- n
3. 组合和导出图片
9 h6 H* i8 C/ Q
点击layout栏,出现下图所示界面

; h( p: W" W  f/ r$ Y
8 b" @( w; ]  A4 S7 i: k
8 X) n" p- Y$ D$ a$ e( X$ t( q

9 F5 V9 V. t# h) K! [  Y
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
/ z/ r+ n9 I3 }& v1 Z$ \  t
8 t* C8 A7 M& E/ b/ m
4 Q' {" l" d+ o1 i4 T) W+ W
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
) n+ I$ X& X' g# [" w+ Y) G

: W7 C, a, w9 B% f( q; F: c8 U' w0 S
3 v5 b  W4 o/ d0 M
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

* E7 B2 K5 `' t( y. O4 w/ Z
$ a, Z* Z8 a' ^) }6 Y! R$ v$ F

5 r% P1 @! ]# C) {* i* @
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
: S6 G% k% C8 ?# v$ _1 k

! G% x) U; b3 c, M# A% c9 t

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

174

回帖

549

学分

1万

金币

论坛元老

积分
549
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
  Y/ n- k* n; m0 J0 Z2 }* A6 B
' y: @$ d- u# h7 V+ b1 @- l
) Q5 [- o) x# R8 t比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12, b. S! \, ^+ E
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

* ]( x# N" `" F# Z" x" e刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

回帖

3

学分

463

金币

病毒学院小学生

积分
3
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|Archiver|手机版|小黑屋|中国病毒学论坛 |网站地图

GMT+8, 2026-6-6 05:37 , Processed in 0.059529 second(s), 27 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2025 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表