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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术

; [, i; O  Q0 x/ w
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
& F# z: G1 k* S; D! u
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
4 x: @2 b/ t" y1 X3 n
——正式开始——

& K) V& G8 g3 Q
1. 折线图

: G+ a& z3 f# M: w' R/ p
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

( G) N/ g2 `4 l/ T+ i
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

) C6 E  B: f/ w8 o1 w. p! |' w% u
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
* \: x4 X% K3 k# ]0 o. S; ?) c0 f
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

0 L5 O7 M. G) R( ], R. f
) Z+ f$ I' Z3 ]$ E5 a

8 P5 R) S, B* E4 Y( @. w) h4 N
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

7 N, `. w2 H* V& u

, Q; y2 d4 |5 t

! Q$ r; O/ m* z  g$ o
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

3 o$ {2 P  f# K3 H1 b7 K, o
7 N8 x) J/ b& e( N0 ?* P
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

1 N9 c; R! z$ T; {( j0 v$ S. A
. }" W, D6 o  ^9 o7 y2 Q6 M
# ^5 H4 a: l5 M
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
/ a2 U9 E6 |. q, n4 g& I

; N7 ]: v/ q' g6 f' B' x+ C: g6 o

' n  ^! _' i$ d/ T* \
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

* W; v" \/ X2 M5 q. z/ X

' i; D& K4 J+ N
* n5 m& U( M/ `* P# m
  在Data栏中输入数据

7 A' J. z% y0 l$ G2 e* U/ R! ?1 h; s
; m; L; K" l3 t$ W9 O: o- t/ ?' \) R

* n0 y6 k' z  V2 w. `; C" _1 y
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
5 A4 ~2 }% `5 j  k- V" e
! N7 c/ I; v+ E" w" s- ~( C8 e

/ ?* }. X4 d1 V
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

* s: X" s8 T0 c1 ?
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
; ~4 y5 v! }. `
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
. ~! p$ U4 Z4 ]& K' z4 Q
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

& S% \: f" [+ Y

. Q* i( q+ G; B/ S3 ^. g. H& x
! o4 t* z/ [1 H6 T
在data栏中粘贴数据,如下图

) R; l  Z9 L5 I6 q1 o( o0 ^# R7 j

+ d" O0 w2 {2 H# q' H
- X9 A3 g9 a8 {1 C, W
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
; I" h0 S5 {9 O* I# L
4 s% A4 W/ \; z# i. r- {8 y
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
+ c" `# X( Y$ n1 M  F1 d3 {
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
) E; |1 q0 G$ T8 K5 P/ s* X

+ K% }" `0 b3 a

/ B1 P( j- C2 E4 C/ z9 F
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
* K+ P* q6 A. A6 e1 s

4 I5 [$ h7 p3 C2 V

3 _# t9 K/ s; ?9 j. e
  将数据粘贴进去
! F  j  k4 z, u1 |1 t! Q6 V5 k& |

2 X5 C  F" |7 A& ^. ~4 K; o: M- r
* A3 b# P- l" ~/ w* b/ T9 h, D$ U
  软件即时生成的图如下图所示:
9 U3 T8 g8 B1 l/ X3 `) l

/ ?. }( O* k5 a4 v9 w- C

) @( p' w7 N) R. B. {1 Q$ S
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

: A  D, j( ^0 X9 N+ i: w
2. 柱状图
6 F1 N2 _; ]1 a9 A3 i6 a
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

- i  c$ O7 W+ u+ D
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

. r2 k2 \: S: A6 d5 P5 {
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

' c, v/ D# z2 F. g! d& U% Z9 B
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
4 e/ p2 y- n* W! t. A

9 P$ E" ~1 `% Z2 a* ]3 i% y6 H0 l

' Q, N6 ~, V2 b. H: @- p0 W
在Data分栏中输入以下数据
( p: _9 ~) c$ i# }- {# O
1 Z, N# t; y7 J2 K3 i

; y9 Y( ?3 i( v( b: c! E, I) M9 B
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

6 k# I4 Z  [  H1 K1 i$ e# Z% h& |
+ p! J. E& X  @9 X+ z7 a; d
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

8 l; Z, `/ f' d  D3 y5 J
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

% ^* N" o% k# ~7 j2 E9 i' e
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
3 \5 p, m, D) v. _" \4 a
+ z) Y. h) }  J; R
7 `/ o% ]/ w5 Q. L
  在Data分栏中输入以下数据

# r: n7 x' V$ D! N% Q
- R+ [2 A/ q: y% b4 d) f

! f- n) F6 u% i$ C' Z/ j
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

" e4 m/ ^! N- [) [, g( j: \& L
% N9 B$ A" W/ s% U  o
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
; a* c9 q. |0 j7 m1 q; i4 A; b. ~
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

$ i1 O, n0 \$ P4 N) R
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

% E: E, C+ s. C: G9 m) I0 y4 b& _

$ e; I7 L! J5 a

2 I1 |9 `7 L7 e. ?4 Q, y
  软件及时生成柱状图,如下图
# K" ^' y; T/ @( }8 l; g

3 p, f% v$ A( M) x* V
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

- R1 o6 n1 W% y( ^0 X& T2 X
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
- \4 ]1 X8 q) X* @" h& H9 E8 w1 c7 d9 t
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
( f! C# r2 \/ r2 {9 E0 H) |
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

: S( V# |+ F6 B# T3 V9 u

$ r) l8 j9 ^1 d0 n; [! ]5 t- o
/ P6 |, |( o* x& t
在data栏中输入数据

! T" O7 [$ a0 e! m( R
/ k" G( W& G% q2 m5 U& H( ]9 g

2 V( v* n! F8 j2 F4 w) }' K! Z
软件即时生成的图如下图
( {( P+ l$ H! C, [) H% a

* D: }( n# \3 Y( ?

1 t$ E0 O: Q7 X8 T
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

  y! J& u; R/ p0 W  {( j" G' W  T
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

: @1 r5 c0 x  a% i5 B2 F+ x- a
3. 组合和导出图片
# n3 H5 `, P1 w6 ]) p
点击layout栏,出现下图所示界面
% Q8 t. |1 d) F: U/ P& Q, n+ ~
% D, H. q7 `% D0 o/ G8 p  V. |

) K, g- k2 p! O- C. g
5 k7 H5 e2 _" u2 W" P( U
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

; {: l2 P/ q3 Y, Y& r
( H; c) z# @; ^* i% I
% x( p  `2 |$ S
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
8 B) ~" q9 n( Z) a3 h
, V" c3 w2 h# M) {) K. A4 a
# t) |" {, `4 A& _- R+ x5 a: i
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

% @: M! M9 a" n+ o& {" F, l
; r% o! W  f. L! q

$ C( d5 S* M: g4 m+ {; m9 v/ `
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

+ H, Q0 w6 i0 p
  t2 X# R3 i% r$ f# H; S7 S( G

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!6 C$ x  ?  }& d0 D

2 {$ [3 H" s' [4 L) p. x) L) _+ o8 L
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
3 e$ V2 D; m( @6 h; n满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
) k* b1 E6 Z+ R) b& e& a
刚好微信圈有这个,就转过来了。

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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