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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术
$ T9 @% p7 i+ c& U" G4 E: M! o
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

& S3 C/ S2 w) d
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
% \0 C" b  t# y& B& N/ W- V  V
——正式开始——

. S: e8 ]  p* Y% E
1. 折线图

0 y& P/ q# T7 V( I5 M- \
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
9 u7 n- X% S% D9 c2 X1 d* m! s
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

& a6 u6 b, a/ g3 _1 J4 x
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

( O5 s* h) G0 T6 T. C# x  R: O
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

& k9 c- U% I* e9 s

* U7 a" i  T. {+ U8 ]
) c  G) f, c# s
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
+ {8 w7 N* N, e2 U' u$ D: N& U; d

$ x' e+ i2 m$ }- b

' e4 ]* Q9 N4 z
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
& Z$ B2 m0 a% _* U8 ]

' H! E# v$ y& p, Y" T& P
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

  @3 m  j& n/ l) |. W- R
# `- k$ i# M1 C4 s  d8 H- X
1 J+ r' Q% T: `1 _) \
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
9 N1 }: v' J# k  f0 }9 f9 X1 E

7 e, ^# U% j+ ~8 {6 t, b

" U% F5 V" U4 C6 U8 N# K, N& P1 ~+ |
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
9 c+ k# l; Z6 N8 q4 A

9 q) o. v3 z7 T% s' D% v3 K6 J
0 {' ]6 A/ f$ H: U" l; b
  在Data栏中输入数据

  O( o9 _3 V3 X( D# k) d: s

+ R5 m+ p7 U) }: F2 D" W

0 Q" `+ x9 d! |1 z4 x) c
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
* o  W) n: A! B

* z! g1 f! G/ w0 ^; P) _' }  q1 d( I
! u, r* k9 Z8 D2 v1 p
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

- p- Z$ L5 _/ h1 Q- f
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
# _7 U2 A; R/ ]0 T& d
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

( H/ N7 c* l' g, I6 ?3 }
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

1 L& ^9 f0 u" X
" Q. c5 I6 _' F0 X

/ h, l- c, h1 U# C" v! _! Y
在data栏中粘贴数据,如下图
$ C" `# X+ x4 H6 i6 U: K

; D) `3 R% @: k- _5 E9 V: w6 Y
% w+ e# i' q; ~2 V% `( j$ `
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
. J5 [* n" N5 P3 m9 J7 `
2 V3 P! j& l( ?2 f
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

7 W: Y" u/ h' u8 ]# q
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
0 U% E9 N6 }0 K; b. O+ q
0 I: l+ ~8 f. v, D6 t1 I8 {5 @

* i. i2 `" q  W5 a  d+ |; X4 \' L
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

5 U6 Q  ^  B4 v' l
$ G, R# }% F; `1 A8 t
/ ^% j# \+ }( _+ w, z
  将数据粘贴进去
4 O# p8 ~& \* O( {; A

4 o+ k) k9 @2 Z, P

$ e! G: f5 _' p% }6 J6 P
  软件即时生成的图如下图所示:
1 {# F4 g! d% L# c5 J9 [

( _8 S2 `! P) K/ c8 K! R+ w& F
0 {. X/ |5 k' B* K0 ?
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
+ g/ w$ f8 S' g& g" g9 o9 R; M
2. 柱状图

5 r6 T( Q, Z4 C; V. ]. r
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

1 \$ u# A- A& N$ w( W
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
4 u% e. O: N. q0 j$ j
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
) n" L7 B/ ^  |8 }) z, x
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
* `3 R; Y7 f7 ]' v7 Y/ {0 G

' h, M/ v2 v9 B7 n/ {( j/ E9 S* W

7 ]! |1 [/ G. r# _2 ?
在Data分栏中输入以下数据

% @+ l8 e1 F6 n; B, {

, E! G7 V1 [$ m$ e8 p; L1 B; z
4 l7 f" e' Y( K
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
2 T: w; S. G* `* x* F" D. w5 i
9 |8 Y* ^% J. F
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

; ^' a" e- o" G
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

0 d. q, N& A  U" J
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

+ \2 H& j$ T, B5 x2 ^# i+ d% q

/ V& `9 M  s# [: s6 ]0 r4 L
# {& L6 Q' q$ Y- H
  在Data分栏中输入以下数据

" X4 A' E0 b5 D$ T! s9 }4 }
( |7 {+ `$ D! @+ P
0 G! _" P$ a" O2 B3 O
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
- c  ~" U) f( u9 V0 y$ U% x# L% Y

% o" d& b8 `: m  H, |
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

" O9 ?: i# z3 g) p
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

+ z+ I! `# O$ i% F+ v5 H
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

4 Z. i6 O; ~9 z! H% Z$ i4 a5 C
: I  K$ y1 V* W( L9 D

+ B2 w% r5 c, \3 M) L5 W: c3 d& i
  软件及时生成柱状图,如下图

6 K3 }: p/ \6 |- Z  O$ b+ q

* V5 @  J  ~1 B' V; n9 S
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

' h2 N- h; \. `+ [6 a3 H' m
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
9 l4 L! A; O& K3 u* B6 |7 m& @
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

( Z( Z( F1 f0 o4 s7 k* n0 Q
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
& Y4 ]9 x7 M: Y" A5 X+ J
& ~0 \5 O' i$ N' g/ n) m: A3 r% B

- O+ D# W5 w+ n
在data栏中输入数据

! T, u- X7 P. w

% m/ l! ?6 ~' O% i8 \6 {5 a
' P# i: y* H! X
软件即时生成的图如下图
3 v. X' f' w( {4 R/ v+ A

$ h: u- z8 R* h9 B  F) q& r/ v
+ L" v- P+ P/ ]8 w) Z4 w7 a3 T, x
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
" P0 B. Z& x' h, r" f* m: i& u
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

' h" P9 h1 V. V! J
3. 组合和导出图片
# |4 `+ _/ X0 {7 r4 u; n
点击layout栏,出现下图所示界面

% A3 e" c( k; i

1 v( z0 M$ E2 t. W

! x) S+ Y- `. X$ `3 m

! p7 Q" s5 j. e% Z7 t7 L
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

" f8 b. i  f# {: f3 U' Y" G2 v
6 K7 B+ R; Z7 Z; Z' Y0 ^1 u* P

5 ]* b# l" s' Q7 H9 K
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
0 B/ C4 U5 ]4 \+ ^
- o. D1 t& Y8 S0 A; {5 W
2 N% E6 T" U2 b2 q
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

7 r3 Z) D- B- h8 l
8 O! D# {- z0 M9 c5 }

% Q. L; f- M9 ~
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

8 ~) g! Y8 a/ K
8 g8 y3 A' R1 }4 o. F6 h; Q% Y

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!+ y5 z. b- B+ s, S1 G. D, @- ]7 Y

5 w- {, V& o) @$ X3 F/ E# m6 t' A7 Z) q! A# c
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
! s  Z6 p6 x7 b# ^7 {满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

( z, Q1 X* m  `; q- P刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

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病毒学院小学生

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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