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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术
. L* K( h! x7 {+ t/ {7 {! P& A7 k+ ]
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
: j) A% O$ X9 j* C
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

; L& J0 @- U4 q6 O" A! {
——正式开始——

, Z/ Y# x4 [# ^" S7 K& R$ q: r5 Q4 A
1. 折线图

$ G4 \6 _4 q% l0 D, Q9 j; W$ q
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
0 P/ H0 I8 R  y7 q) t7 o( U! t8 `
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

  s& ~( |1 S: ~7 X* T- H
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

8 ?& C5 {) G# \' v. w6 W
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
- q$ C* _# H& @" h1 C- J) ]
3 C5 X/ g9 x, D7 c
; G& V# w0 |9 J
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
8 W& x5 z1 p7 T5 X1 `
3 r1 m6 d& x* K
& s# c6 @: I3 c1 f7 l
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
/ ?% d$ P9 W: z

$ O, g3 m: q, w+ h" v- u
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
& J% w9 V4 V& `9 V
1 B, N+ F0 g8 x. F% @5 [1 e# J2 a8 i4 M
. _9 @9 k8 V5 q" ^
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

) `% z! s: q+ i1 G, k$ @* M* F- {

" `4 |# r9 K: w8 `/ L

9 ?4 a: ?0 `# I3 R7 {' ~$ {: b3 n+ {
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

. E/ n% |1 L6 F

: ]$ C& W; Y0 D  r7 A0 M( V' H

- O3 n* ^& I5 f& N7 m( K/ ]
  在Data栏中输入数据

. v% p3 z# H* v& Q- [

# w& c7 r/ e7 p5 P1 N
0 |; d/ l0 `+ K! k" Q1 P
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

+ I; g5 ]6 }& l9 _, P8 m8 m, O
# X4 u$ T3 @0 e0 S8 |9 w, V$ q$ {

5 t. x) C5 J" ~- D5 T
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
6 M8 E. Q+ h% n+ G( I$ ?) n2 t
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

" m4 q8 D; n( g+ U
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

% K, X: y& Z. X# ]# ^! n, F
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
3 c/ A' Q3 h6 e. f# v- E
0 X1 b( t  g7 y2 X% G7 I/ v

4 {, F- C- \% S
在data栏中粘贴数据,如下图
8 ^1 P. [1 c6 L! |
# X0 k: h7 k0 j0 v

2 H; T4 L' Y4 E3 C$ }
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

, m  V4 V) n* H- ~9 Q) y
+ W& R9 g, l# s% K1 v: n! r
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

# {& D; @$ ^& j
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
; z  J# X- ^( ?" ]* \' O) a; ?4 j
9 Z, D0 |! Z8 ]" x
( K0 k8 S/ y$ b& O" c! i$ H" n
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
& C5 t" Y' I6 x# _$ |/ I- m% R
" m! D  O* q8 R* c: J  Y

, b! Y/ q& m1 ]' N) v2 n
  将数据粘贴进去

. l6 X1 i% Q" k  h
4 p5 {, B' {3 i; O

! j5 [6 G9 N4 |! W" w
  软件即时生成的图如下图所示:
0 b$ F; @% Y! R* Q/ f1 ^

- G9 Q: i# l# o. Z7 |! s4 I. B& L8 N: E

$ V( E0 m6 X2 m3 s' Y0 X6 y
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

# ^2 }$ g, o. o* t% i+ z/ Y9 F! s
2. 柱状图
$ w5 E7 J; d+ ?/ U2 H
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
$ P3 [6 r6 i- I  c* x1 z% w
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
, l+ b# c0 ?5 O' m
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
0 M$ Y  k- ~! E2 N1 f6 @7 x/ g
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
" s" S& l- P' Z: J$ r
* X2 T5 K: V; [9 k9 ?2 O2 I

" C9 J% M8 o. P  M7 C0 _" {
在Data分栏中输入以下数据

' S7 ^9 |  ?) z$ e5 u, J$ ?/ O6 R/ C
7 n$ H: L' I( w, R2 ?- t9 ?; R5 i

7 g2 x; i$ p7 g
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

8 o! N8 X/ T/ i# z
4 K% i1 `0 J5 o+ L
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

4 t. ?. j7 f& U) W9 {9 R0 [( d
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

' u7 q9 ~) O  l0 C
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

; w4 Y( v4 w* v, m

  j+ ~1 M$ K, v# s" D" L3 O
: |1 M/ O4 W$ m9 ?& ?+ w
  在Data分栏中输入以下数据

  Z$ A  z8 t: n% `/ w! E
, o' g" W) \) D/ }
2 |6 u/ n" V* V
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

  L  l! Q+ {/ |5 g1 y

7 ^  L  m9 e3 P  E% S, e- F, |5 I
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
- n5 ]; w3 e  G7 P# h
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

! @- m2 X  K: {! q0 ^0 R9 [/ u
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
( C# G% h3 H+ l
9 O! T) h! }. w- d; y1 x7 C% V

/ K. A4 a& M- M- A) g( @
  软件及时生成柱状图,如下图
. w) B# G0 ~8 M' h9 l
/ w) g1 R5 q6 G. r. ?
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

2 N+ l$ n4 D  Y8 N( T" l0 c
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
1 a, \' ?$ w2 R' D, J
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

& ~4 ?0 I: B3 n. [
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
5 O- a' h. Q4 T2 Y: ?7 ?
" ^7 Z7 M# ^% V# p4 ^2 P

% ~' t+ e+ v% k% @0 E6 I
在data栏中输入数据
  O9 @% f1 q8 n* |7 }% W9 z& d

8 l2 {& ]+ I4 ^* v  R9 a5 E
! n/ D1 ]! v! W3 ?: x/ f
软件即时生成的图如下图
) v! M1 L* s" J/ ^/ ^) u
$ [. g5 L& I* d# L; T5 O
% h: J& a  w1 b2 ]- ]+ @- G
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
! ]( H$ f2 |; \, [: y
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
% u0 L( Y# S1 L1 s
3. 组合和导出图片
5 l- @  w+ G* w
点击layout栏,出现下图所示界面

! V' u+ k' m1 x! |) Z2 Y
1 h+ X- X. O' g' a7 n- B: g% x

1 s0 }0 Z' \( R( R
: A2 h" g* l7 b& {5 F
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

' `' t$ f$ n3 A1 ^

2 p: d0 ?( W0 D

0 H3 D+ `: r  U
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
! w5 Y" ]' w; t3 E/ i/ b% u7 c

( I2 j+ h4 o# X2 k
! _, u$ U+ @/ ]
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
: H4 `8 q' ~" [4 N

5 f& I! A) a1 Z% f  D

( ]$ y+ j4 O! u% Q( [; }
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

5 x) Y2 g8 s0 @

! G% ^/ c" K0 A: d0 i

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!$ T! u3 |- z+ S# f, T+ w! q

; g0 D2 P' \4 d- g4 M5 W% m. a/ Y; J) k9 v& ^4 ]
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12! F2 p, w: q" J* d9 r" J
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
* Q4 n/ `& f' V) z& [. ^
刚好微信圈有这个,就转过来了。

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病毒学院小学生

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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