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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术
1 `1 w. a* P6 B( K
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
1 o! y4 E7 m) l# H
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
- |7 ~7 \8 C2 z8 ?% V' p5 K& s8 L
——正式开始——
0 p- u% s; }( y
1. 折线图

( q' I% f2 V% R/ w' D$ b0 T
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

6 Q2 \! Q$ k' v! g
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

7 G8 |& n- t" x: [# I' x
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
  h  P' h$ ?5 a- X4 y
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
+ A" u5 G4 ?5 n2 ?3 q! [  f3 |  k& m5 Z

9 T  v. n; o. x0 u2 C+ C7 [
' }( }& A5 W" W' k
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

& j+ I; o9 h3 d& z  ~6 b7 M

6 m3 c7 m  l  E  K9 t
% ]" u6 @2 e9 F5 P" I( S
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
* V" u5 F9 b  N5 w, }/ t, H

$ }, h1 `# ]: {* k, z+ t
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

* X  b- l: Q1 o1 F. V0 f# w

8 ?% [7 Q  q- M# \
, C3 m5 t: \  z' L1 ]0 ^) j7 ~% b
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
& _; A) y& i; n6 X/ w
# h( x. x" ~& q. z! T; U

) W- H( z3 k; M2 E1 ^- n2 y' [$ b) j
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

  |0 O2 C1 ^: h) {) o! q! E

# U5 a, S1 o7 @  t) d
. W: S% X; R5 j
  在Data栏中输入数据
0 b1 W8 |/ J2 |: H- r7 J6 G2 |

$ _+ {; n- h6 s) x: U
4 d  T: t# L' F" l: v) e4 I
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

7 ]& V" z: w, L: w7 E& r
1 u0 J% l1 m2 U% a8 a8 q
9 h5 K0 |0 e2 H: s* a* M
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

: Y) y% [- y# }$ f9 u
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
! q& Q: J+ n! R7 N2 S
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

4 o3 x4 L& w# s9 |/ o
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
; Q) L4 D: H! k- J/ S7 p

6 k5 u! \) m: g* E% C7 y: Q
" v# d& Q& s' u) g7 K% u7 i9 z( b7 S
在data栏中粘贴数据,如下图

5 C) ^% q" ]3 C* [

: T0 B3 x; v6 ]: U2 ^" T1 Z

, |4 i5 \6 g" }  @  ?
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
5 e9 a% P$ p6 j& c

/ X: R- h7 N) [# I0 m: L1 A3 q
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

9 u; q! c4 C  W. q% j
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
& E: l' M# C1 t- @: ]

/ ^* \0 @* f9 v+ g

% u- T  R  Z& A1 \2 R- d4 u9 {8 p
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
: c& N: `* ~4 }! R3 d

9 M& t% }+ t: E0 }6 j  K

. X) `5 T  Q3 I! l  E2 X- f* X2 a1 C
  将数据粘贴进去
5 j7 l6 t& l" W
; K2 x8 `  Z( e; H
5 S4 G2 \' p* H  U9 p5 M( X
  软件即时生成的图如下图所示:
. W# W6 P! l" ]1 r
# R9 B7 Y. G( v$ A& m
* o6 P4 o0 ]. c- H; H
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
1 I- w' [- _4 B9 U, E6 M
2. 柱状图
( ~8 W6 e: Y7 k8 u( @9 X  u
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
2 A$ \# s0 v9 W7 t. N1 m: D5 d# K
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
% e+ A6 i1 ]; U, g2 D
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

. z4 e  t& m. n% m3 v  z3 c
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
" O1 g, g$ Y9 o& j! [8 W3 W, [

/ i/ k4 C& ~: M

+ g0 }' Q! `# v- i) H
在Data分栏中输入以下数据

) j/ c) h. Z  Y

; `8 ?4 G% Z1 e( S3 }

3 b, C  q  G) d
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

0 p+ j$ @. g1 x7 ]
9 l* J2 b9 j+ l) v6 `, @9 }; _
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
6 R3 c' l. b6 K& {8 g
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
( g: ~( A/ x; U7 Y
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
7 v# J' M. d4 [9 C$ ^5 I, j

+ \' b) _" a1 _9 M! _6 O
# ?+ _0 x: X4 }/ g
  在Data分栏中输入以下数据

2 H( N1 e6 U& `7 q* R* Z$ J8 D
0 {1 @& G, p% a" }, v
7 s! r- q/ H. `" w
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
' V& ^+ Y5 \/ w$ j7 \0 u/ Q
& N4 _8 `& b8 L) h
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
( u2 m8 z3 s; B% A2 t
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
; {8 M+ O. C/ ?* [4 k2 C
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
. \' f  y# ]3 p1 F

* R8 X/ u$ P$ x* Z6 I9 l

; E0 L6 q! }6 U3 F# ?- t  A
  软件及时生成柱状图,如下图
+ e0 r1 L$ f2 D

' |# v! l7 V3 Z1 t
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

1 C: g* N- a9 K7 u* [' x
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

) n( X% h& {1 r, M. C
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

4 B) W" P" @3 X6 T: n' a* C
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
" x. z( G2 V6 }

3 v) D; Y$ I$ T' P" G! @# D

1 [0 G9 W% D: g+ J/ R
在data栏中输入数据

5 u- p" J+ b) F8 z8 e; e

# T0 S5 U4 Z- k- ~* n; C

, g5 `3 r. T) u$ ?' Z# s. H
软件即时生成的图如下图
( l3 F% x! X! F" F# q
6 Q$ _, f; z4 p/ B7 c, D1 _3 V
( }$ i! v# y5 x+ t( d
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

2 s0 [4 N" g1 B. z. ?0 x
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
: T& ]7 }& N3 t5 Z
3. 组合和导出图片

9 M0 R) u6 g  Q3 X+ n6 O
点击layout栏,出现下图所示界面

7 D& {4 n5 V' F) i) e/ _
# _5 R- v/ u( j. _) A) h0 @, Q
) y5 b2 k8 P  R8 e

3 u4 ^$ ?- m) {! `' N$ k% w' I
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
. G8 T3 M( D8 B# _0 m& x' x

# B; M# ~9 W: B+ q8 m
$ F2 P! K: g& ~' l
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
( W: |" X, N# A: V% Y
4 b7 q( r: Z, S3 R3 F( O
2 b  ~! Y. r( I4 G3 m, R
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

& T. e( H7 `/ y' ~* @+ M+ Z) Q

  }) k" K" O$ E  J  I4 B4 A
' K0 M9 W# @0 J" P
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

2 `4 n9 q% T& k/ D2 }

% B: s) G8 P( A7 _- J3 C

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!& L: L' d- c2 T0 N* z  [. L
6 D1 M/ l  J6 S2 t7 n9 W
9 [. @8 Z/ f& U  S' Q" b
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12! J/ R! K, t/ Q' U7 m" `
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
2 b6 o) D- X( d- J$ s, a; z" B& J
刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

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病毒学院小学生

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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