找回密码
 立即注册

QQ登录

只需一步,快速开始

搜索
热搜: 活动 交友 discuz
查看: 3361|回复: 4

如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

[复制链接]

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术

3 v7 a+ [' f: U1 x* r
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
8 Q1 P- _9 q" {; `
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
  X0 j. O- W6 H2 P
——正式开始——

% k$ ~( ~0 v/ y, [. w& w
1. 折线图

' `' C$ g& B& E! c8 N
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

% W+ C/ r0 d' ~
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

! O; [) S1 p2 Q7 b& Q2 y5 O* l
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

: U$ x- D& j; s: K; I4 ^7 t
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
( D8 K4 W, R3 a  q; i$ w/ Y

0 o+ d7 m& |( `1 x4 ?
- @4 N7 `1 e1 r5 y+ q' K" L
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

' m2 I+ e: v5 |1 M1 Y$ R- [, V
5 Z- Q1 d9 {9 R- \% j

4 E4 P* X/ u7 ~4 n. i  _
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
# ]% l1 L! s% D
% \: @/ P, L" h7 e
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

+ V! t, f9 G6 D- j% d0 }

$ X6 n7 |& N, w( o

. n- B. J) I% z3 j( r5 B
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
+ p2 Q5 ^. O/ m9 \% h1 g- b
7 K' U( Y) H9 _2 j2 g7 m
2 Z& ^9 e& z# O2 ]( r4 D
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
5 c9 F5 p$ d" ]

2 S; [; ]. `! J2 g( k1 L% J, E$ }
8 @6 b# D# j0 \. n+ B  W
  在Data栏中输入数据
' t) c* t! a: Q, d2 I/ f

! _4 \- b; h7 p; L8 g

! F) a2 C! f. v$ T! e
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
5 T7 ^- R& S  A

" e) Y/ g' {" H2 E- }
* r. W* ]5 w2 U6 z8 \  r6 u- B1 f4 K
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
0 ^8 h$ ?9 N" n7 A% t
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
4 g1 o( A! k" _! N$ ^- o2 b5 D( T/ C
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

/ k% k& V& _4 C, {3 `, s9 \
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
& }3 v; c9 F* s+ J! m; M
7 a& h. i4 U  j3 L, s5 I
9 X  h  L, r! Y' f, g  t$ H; H
在data栏中粘贴数据,如下图

) J+ N* C/ p  w# c# q+ _

- [; L8 u! _% Y* `
: B; [- U" J- I- ~7 H# Q/ J7 h
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

& R2 F" k; f! `9 p- e+ ^, X

+ t& F; {% o* M0 E$ G% x
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
+ J8 P5 R! E3 Q3 T2 p: i% N4 j
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
) Z  A- }, Z; Q5 }2 N, h5 s1 q( a

5 s, A4 ?- R8 B

0 o) P. e7 {; A" i" |
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
/ O+ b6 o3 e+ y. P; n- `3 S
' A4 |6 A2 A2 x
& ^* t( X0 P1 s6 O, g' u7 b( N
  将数据粘贴进去

! X2 W4 X' W* H6 f

! _& o8 V, W, S. ^% c. f
# A; H/ V! T, `( {% ?
  软件即时生成的图如下图所示:
/ v* @4 g2 f: B+ m, r

( v. X* |& B' d; ^+ {- Q/ `4 j% x

+ w) }/ F2 [/ Q- q
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
/ B2 L; J: L6 {3 I
2. 柱状图

$ p! U. p  ~/ \0 ]" [1 w" K; v$ T
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

& A' r2 B1 F8 t& Y' X7 N8 [- D
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
6 u# o; H% X! Q2 z( l0 h1 K
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

, ]$ O* B* X# ?- ?1 \
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

, v! S" |9 l' G9 z, {/ U
6 G) b2 {/ k0 I8 n" a$ O  U( Z, I
. l6 W. M- }" N% t( R
在Data分栏中输入以下数据

9 G' C% j! J3 Y1 ^# k5 i
: ~5 R' j8 o7 L- S4 K; ?

2 \! v7 M. n8 D/ \" a
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

* T% f/ ?2 [: J& B- Y

- I4 u0 q4 P) g& t' H, ]& B
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

* ^% ?1 v7 K3 V* p: K# R
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
1 F0 I  F4 X& O- r/ I
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

( u: ~' Y* h. |4 q9 T+ ]3 S
6 t/ i/ u4 i  p2 R  `6 G: y
5 y3 l3 a: a# e
  在Data分栏中输入以下数据

. \# Q. C% c) E
8 M7 @$ n! j1 q6 R# \& }" _' m# d
/ F* e$ k; q. Y) H
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

0 ?5 U3 b7 r# X' L# k+ }

6 L! @9 n4 z- f& ]
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

( ]9 z' I: Z/ w: h$ c
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

- r; G# ^( Y$ ?3 s! ?4 x, L
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

' g; }% T4 t5 Y% x- N
$ @# {* K! C! u8 I  p5 n

! l) |$ u+ l8 g" a  B/ o
  软件及时生成柱状图,如下图

/ V" T. q8 ~" g2 c

9 B9 F7 K# H7 h
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

; b( P3 {9 n( I5 |5 c& n) ?
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

7 H2 p/ s% l& v1 {! E
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
- R7 W9 ?! ?) R0 T1 E, D
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
% D5 \( z" q' _
; q3 |& k+ ~$ f4 J; j2 O) b  [
/ Y) a0 |6 G; {( J, P8 U' A" I5 y
在data栏中输入数据
7 P* N0 ^% b% v( m

: t* W: q, e4 V5 v' u; e6 G: ?* s
. p# R: I7 H" s+ Y  D
软件即时生成的图如下图
6 r3 K) E  R' ]; x9 c$ F: d
" l$ b: x" p. F. R  A" \& E  X

, k6 [/ q/ R" J6 i* T+ A9 F4 E
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

, I) g; v, o9 \+ ]
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

3 P. X: u6 X! t
3. 组合和导出图片
; l" y4 d8 {* Z4 m5 S- h4 T
点击layout栏,出现下图所示界面
( x( n/ c) h& s% A8 |' V4 ]6 p
4 Y) l" S( `7 t
* _/ Y# c) z& V: a! ~+ }; A
4 |6 O1 o6 Z0 A8 d
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
5 j+ ^0 ?. `8 N4 b2 f' U
; G0 `- w  j0 s: B# S0 p2 o1 ^: }$ R) G
, r. x  x7 X) u1 c/ y* |
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
9 ]+ N4 ?+ F9 T
& ^& U" N# `2 ^4 u6 _
  D0 ]7 p/ D9 J5 [( u
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

3 p% V2 d0 U3 B, p8 c1 u7 a
7 X( o1 B* U: z0 V$ C

# j7 v( c7 }- p" j: l& C3 p
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

  W  S* b% p% @( Q/ e9 F' P4 E6 i
: \( P+ Q" u$ \+ r( N

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

174

回帖

549

学分

1万

金币

论坛元老

积分
549
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
. I* c  `; F! r' u/ c" F& D! e! Q9 b% F% K$ E
  [  t9 @. Q: j* w9 v" H& [3 F
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
) ?9 r4 _" J& ^+ W% W( J满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
' x4 X* K1 f% W, w  b8 M( x% J
刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

回帖

3

学分

463

金币

病毒学院小学生

积分
3
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|Archiver|手机版|小黑屋|中国病毒学论坛 |网站地图

GMT+8, 2026-1-21 15:07 , Processed in 0.238309 second(s), 27 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2025 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表