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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术

+ r8 K( w# V1 a0 ]9 B- H1 r' K
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
1 \& X; f  {7 R" s0 C
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

3 S( {% T5 Y, D2 }; b6 @
——正式开始——

, s5 d4 L* W6 U0 P& w6 s
1. 折线图

1 p0 F+ ?" J1 n- {0 L
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

3 D: K4 v) X$ ~7 ?; D5 a
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

. H4 Y4 C2 k) O2 F& Y- N
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
0 Z! Y; Y$ {& u' X* [- v1 i# ^
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
3 d' k7 O# \2 n% I* O
7 z& L  N+ ^" r" d' d: \7 N; d# g
1 F4 ^- R6 f) S! e! }! g
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

. [* _4 G# ~+ g5 @9 j

! G+ B4 M3 G  V, m% c

8 J) Z3 G& B! T) `: H: m
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
9 Q& n1 c9 T6 o  `# H$ {0 E  y
! V* E* E* T& f2 A; ~! u
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
$ S+ w- T/ B9 E% R6 r" l
/ H  y  T$ B0 W4 j! o  E: ^/ B

( H4 C( _, t  X$ Q# E
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

) X( ^) }, ~$ l3 j

% y+ z* D* g- n% X
; T, Q( F- L# F" N/ l$ L
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
' O7 N  A, m# R- g7 e( C, @

( _9 l2 w7 {4 a

- Q6 Z( k9 D/ i& w3 x# [  A; t
  在Data栏中输入数据

- I* R, l$ d# d. i4 Q, b
" M6 V9 t# J6 f( l) J) X

& j. T. f& @" s& c! m
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
) n+ U6 N9 H: U4 E+ z7 |5 H

) F; q7 \  X  X/ z& [3 A  T) W5 W
" Q* S" B6 n  q5 X5 f
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

% O/ i! }  F, w$ U- C
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
% [+ D$ @+ L/ F( ?1 j* x
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

+ V4 d2 m) V# o
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

& A# U4 [8 _) [; N+ T

! R8 D! a2 {! p" }( x* g' Y5 }' s+ `

6 u4 @1 _- q/ D, u
在data栏中粘贴数据,如下图
! M) l& W# c2 ]* M- B* a5 s' v
$ V, L/ V4 ~( V8 H9 W

0 o. o  f; V2 m2 a
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
0 \* R( R9 J. u# w

& D3 d- n9 W! H6 o
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
0 E( M! f% _4 m0 i1 P* S
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
, \9 |: @. w, \: b/ g6 S/ [. q) }
, t( u! R$ r2 [6 }) Q
, I! W( r: M( @: b5 s
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
- B9 L& s0 s, Y( Y, P; v
1 }/ o4 t0 D' F
/ I8 ~; b( a; w; B4 S# Y# I
  将数据粘贴进去
0 v! b' X4 H" m, Y7 ]6 C
$ B$ S5 a6 b% ^" ^) B' K

9 Q. }* }" p- b0 s+ g* r$ c$ e
  软件即时生成的图如下图所示:

# ^: S$ o1 b2 y4 P* E7 R7 [
/ ~2 ~/ Z  ~$ G" ?

# k# d( c" m2 W
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

- O  r9 f7 \/ L% t: @
2. 柱状图
$ P+ S* B8 n" G& R
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

7 o1 q/ O& L6 Q8 P0 W
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
, |/ L- J) {$ `) V3 s8 N
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

5 g1 J0 n% W6 ]3 k! @% r0 K
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
- ~3 k8 N5 B: `9 {4 r3 V% s

9 ~2 J! d2 k( E2 _' D
/ U$ J. h; w+ r* m# V: D
在Data分栏中输入以下数据

/ u; A% m2 o1 ?. a4 i6 ^
; s) B3 H9 ~; }8 Q$ c1 a6 R
" R: J$ K/ h/ f$ E+ {+ {0 i! d
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

1 L1 ~$ O% p" z6 c0 z

" X' @# |& @# p3 `7 d  n
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

% r2 z' ^; q0 f. ]
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
5 H, ]% J7 a  \6 v/ V
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
1 K$ w/ L: v3 b/ B+ b' i/ _3 w

9 y) q  _! b" v6 H: X9 G  g
1 J& K) `& U! b) i( P4 |& z  J: U
  在Data分栏中输入以下数据

( u% E2 d1 N1 U) Y8 J; w
+ Z: X7 W7 d- h7 k! z9 S" _

0 k% V! H' x& l$ P8 A' q+ j
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
* L& U4 l& e0 N' D" P
* _1 a2 Y* U) k- a5 N& R0 o
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

# k" L# A; d) I
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

1 ?; i$ D- x% y( n" ?/ D! I
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

1 ]0 Z4 F5 S. f* l1 Q) \9 _
( \( F4 m) K  K" o/ ~4 @
' W4 O9 I; a1 T) s
  软件及时生成柱状图,如下图
* b! \( ~" z( B8 I' h1 t( |+ H$ |9 o
4 ^7 d5 w! @5 A+ m. e( `* m3 i
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

; J5 U# P% N( N' \
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
# x" I7 h2 H$ @
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

% ^, R6 v) Y9 g
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
! f& `4 G( a' T6 ~( r4 O0 z

2 e' r4 @+ s) W  X) o, F
0 E, c" X" x* t# N& o6 W  L
在data栏中输入数据
2 @+ r. S. y" k" ^- c
: m+ u: Y/ ?) m& i2 I6 R2 M
: M. y* T' H4 E+ t2 W& z
软件即时生成的图如下图
# ]+ ~0 w: [4 K. q$ D3 B$ F1 s5 v" H8 z
# ^$ c( U. y  A+ c7 ~4 V3 l6 i

% V$ R# P7 i$ o
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
9 F$ \" k% X+ e1 |
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
, |( {. P/ i! @# K
3. 组合和导出图片

: ]1 F1 \6 r  u: ?) N- x4 d/ U8 v0 Y9 t; R
点击layout栏,出现下图所示界面

4 q& W5 G1 i0 z# \5 v! S+ K
- J; \& }- V. k5 ?" V+ Q7 J1 O# C
2 ^# y4 Q' F% I% b5 K8 x$ H

' N! c9 F) O9 O6 _
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
! u8 n, y2 S, Y& S7 s

  p0 R7 z) f: k- U# K3 X0 ?
: ~- b/ i) g# ?9 ]4 `
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
) Q& S% h/ n* b. G* Q( y1 D4 \
) y( P) a" o- z6 o, M" |) ?

4 y8 i# U  M4 F% i* ]
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

, o4 d: b7 b3 i6 M
! q7 t& H/ Q8 B, J0 F
+ M0 m6 }* C# o# G% x
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

+ w  p7 |  h: j' d3 A' q. U
. x) M6 u% H" s% o9 T) Z, E

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
8 x( p! _3 R$ u1 A& x
, u2 D* S  V# r1 [3 N6 F+ A# I4 X- R
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:128 s; A3 [/ r' m8 z# x
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
5 C3 I# z  Z! d4 D% P4 L
刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

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病毒学院小学生

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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