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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术

! O) G) O  }' d9 z( B$ S' p' o- g
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

! [& i1 Z* n8 V/ Q, g
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
3 o+ C8 x4 @" }3 `0 ]. _: x
——正式开始——
% H0 N3 s0 ?& U6 o( r7 i6 Y: ~' V
1. 折线图

& W) t' s; u! A7 n% ~
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

' A% i' P) q. r% T& ~: z
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
# n& V6 M6 w* p! f0 w
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

, N% ?& P& Y9 m5 |
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
3 N0 |+ v( Z  m2 \; c, @9 B
, _$ Z) |( |1 y; r
4 Z! U! y8 I$ G: ~! x) x" H
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
5 P/ R, j4 g, A/ ~" R) r% n: P2 h
3 R1 T; y5 w; l. z
9 x5 A7 y4 m0 r# ?( A, r2 f9 ?$ E
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
3 h( h: Y- i7 w' B) R5 R  ?. A
" i: |* z# O$ y8 B. t5 v
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

) f" S9 m& y! f
7 k6 W2 N4 I; \& X
; |8 I7 H9 }! V4 b4 U4 c* b
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

: Z# T1 Y6 ^( Q4 S' b" u

" i; p4 X( X5 q  r! f

, R6 d! X' e. O8 ?  y$ t
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
" I7 `- b8 x7 A0 o( Q( k

. ^0 D& y+ R3 @0 Z8 |

+ o; _. B' S) q2 \
  在Data栏中输入数据
( [2 W, K* B9 q2 ?$ c8 u7 S

: w3 i2 [7 ~* t. L/ J. \7 j
' E; o3 Z' O" L7 Y
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
+ o5 B( q6 _, A9 W
- q7 F$ j( g% y0 T

: T- S# ~- \7 x3 y: n) m6 f. I4 s! v
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

1 C6 W7 m  h9 F
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
7 u5 \$ |3 o  @2 F/ U. d
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

( U8 g# h( C. U# r' w, p: I( Z
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

! k; U0 i/ p; X5 _5 S% Y

+ k8 e  S! C5 O4 C2 u$ `9 f
- E! M2 b  S% W) h- [3 u0 f8 u
在data栏中粘贴数据,如下图
$ r6 D, u7 n8 U* Y) s. i, h
; ~$ N+ N" C: L" ~& `8 Y
7 O2 J0 q' x4 ?" J( I4 F
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

6 t1 T* _8 P' ^

' E- P( u" d3 M4 R  n7 ?
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
, G, T3 K0 c" X" B
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
: [5 C  f* e* v5 a! o8 V* U

' |% E* d  }2 o; J  ]5 o0 w

, h6 l/ M7 Q3 z, ~6 {
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

( k9 q% }& z& |  s. g* e' v  ^

2 R3 n$ g" P: X- ]
+ Y9 c4 u6 E0 F
  将数据粘贴进去

- c3 P; F0 f4 H- ~3 a" f, W& P+ h

& p  x. i6 ~& v; W  i& N3 u

- b! r% a( h; `3 m3 |( A/ w5 l0 O4 T
  软件即时生成的图如下图所示:
' Q2 w% b* |0 F, S$ J- P' B$ S4 y
3 s- @. O9 \' f2 D- w$ ?
0 k: J* i, s, N* Y: f
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
1 y3 J2 d$ a! z
2. 柱状图
  f7 a' Y, K( e/ i, m
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
& f- ]0 K- F$ Q% q; J% b
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
6 {. T! ~. {* G! M$ o; k
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
. K; ~9 ?) }2 D) L" a
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

  ~6 s1 e) _; U) G3 e4 p

: _( T; S$ b  c3 z$ L

& x2 j+ i, L# A  W. H) A, o& m
在Data分栏中输入以下数据

, i/ a0 ^& t6 n8 q& b8 O7 @! q

6 R: j! S+ R/ J. K
7 h0 f7 U# f+ p% B7 p
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
) f0 V0 P% c5 z8 ]

' C$ J  n" i" l% e' z
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
' c& p5 N3 I' Y& P/ I
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
) q5 [4 q* Q' l0 N7 R) [
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

' ^* f7 d" C9 `% S" w' G+ z  X- T; m

0 F! R7 ^9 X! f. ~0 r3 G& I

8 N& m3 Y- j6 f
  在Data分栏中输入以下数据
  R6 f5 N6 V, V- Q' v+ B
0 z! e: J3 D; B6 t& R4 k
' g6 f  Y7 U1 p
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
: C4 L8 Q8 k, N3 x- w: I0 B9 M
& u# ?  u" n2 P) g0 U- v0 A1 t
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
' M9 @; `  D) j" K! e" ~3 O
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

/ ~0 F" p; L& M% X
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

9 Z. h7 e/ }8 P3 ^" z: `

/ u( R2 I1 n6 c( ^

6 E3 q- g: a) ?8 N8 l8 Z4 R
  软件及时生成柱状图,如下图
* `* o6 E" x/ M$ ~8 D4 s

7 m' L# V9 C' A1 U
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

( [/ H: f% L' n! `0 V8 s
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
! ~) A9 m# k% F9 Z6 V3 O! f
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

3 @9 S! Q' C3 |
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

. ^$ R' y; c: |' v# ]+ K
5 ^& ?0 K- i: Y+ B6 l
3 Y& _7 s# |7 j+ c: l: V1 g2 K
在data栏中输入数据
; _  I( V* Z9 B8 A2 `- `1 ~- F- }* M0 ^

4 j* ?4 W: \: L8 S

2 ]/ W& R# b4 ^  b: K0 v! x9 s3 _/ P# K
软件即时生成的图如下图
% a2 i2 E, G  O' B) ^

7 W# @+ a! F7 J, i

  w) K6 Z4 M$ z
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

* d: M2 w* h9 n; n, p
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

% _, m. k$ ?/ }# l0 G
3. 组合和导出图片
% P9 D* y+ x9 O. _& u
点击layout栏,出现下图所示界面

1 [- q& o: J- i  T/ F4 N+ p
: M0 P4 s; Q8 n$ |( C& |

2 p* u6 e3 t: J' m

" ?( }( k" d* O( C
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

  f) J3 K9 |  S# Z- j/ o1 f7 e% A, v

  b# S/ r5 I# i0 t
7 n3 d: n% m3 }. Z9 S7 x1 G9 K/ `. v
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

" G# m( h- d3 B2 f

  |7 U5 v1 a# x0 [" [  ~7 G8 b

# H, w- t" k$ R; s) X1 {7 B
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
' V* e* c* \( @% N8 ^2 l( w" ]# |

4 `: ^6 \& `5 n5 [) ^
- V5 a9 ~8 p) l3 u4 a0 E
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
: e- Q2 B$ ?) c. y( \4 ]1 c7 M

: D: f" j- _' e8 D0 l4 y

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!: z  ~7 B' G( V6 d: K( _
* I! {0 g2 @7 @% O2 N2 @
% O& s  W; _* d* M7 k5 G
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:121 H  P% D3 ~+ A4 g' K- R
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

* G. T# y4 Y) t' H# s刚好微信圈有这个,就转过来了。

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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