找回密码
 立即注册

QQ登录

只需一步,快速开始

搜索
热搜: 活动 交友 discuz
查看: 3616|回复: 4

如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

[复制链接]

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术

& y; U9 S8 R! e+ a, @& @  u3 _; H* l) S
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
$ \" R/ W& y( P
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

' [! P* w4 N$ @( @/ p% p
——正式开始——

% V; A. V& N  p3 r5 H( @* v% T& c7 L
1. 折线图
: u0 h8 {' ?( y' K! Z" ?$ k
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

/ i1 H. Y% X; l2 d7 N. |
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

$ b% K+ n; ^  ~7 j! R
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
2 P& _# ]  E8 ?# P* X& V0 a
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

6 q' T% S* B' d- A
- ]( {, B( K5 F

2 A+ O+ h' [* x2 q
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
  K" W0 n3 R$ L
4 T! }2 Q. }- D/ ~3 R& V
* D) h( Y' S$ ~% i0 z
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
, S. ^1 o/ M( ~: n
; k- ~' x% z, r# r2 h7 e
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

) f* s  p/ R" w* R- v' T5 }0 G. v
( ^1 K! D1 V8 J0 o( Y) F5 N+ |4 L

& A) Q9 N" D- c2 m( u0 c: G
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

5 r) T! u8 b. s$ X: C6 C% [6 ^
, y# `+ `& g) F

$ n! s- y+ p' x- J9 d
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

4 {4 y% S( a# W5 v! X

# w" y1 I- `3 N+ t: V& Y4 Q

7 y! U0 L5 m3 A  t6 Z
  在Data栏中输入数据

' ]  f, L3 L8 Q6 T6 K( w

' P6 w6 R6 ]- H, h7 X/ z* Y
) h1 {. h% R; f% ~
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
# F: B& G; l7 E, N+ x' Q% ~6 r' |
( _4 T1 J1 I0 O- R: z- d

, q4 a+ p  M9 ]4 |" E; K
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
% ~, Y2 m" @& z
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

- B8 q. Z% P2 e% F1 y. |
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

* O* r4 Q8 ]. t+ W1 M
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

" @. D3 B' E# d

2 v! O4 P3 K" N5 J. F; D; h5 v  T

0 [0 }2 h: f5 K+ v/ J2 g
在data栏中粘贴数据,如下图

- @8 f* X- m4 v

$ o. s) @% e$ J* u. d( O
" s, k7 R2 Z7 x# B! o1 W& r
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
: }# K2 [# j0 \5 Y/ b& ~
, T* ~+ m; }2 X: ^7 G6 }7 l
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
0 |$ T& E! }6 @& B
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
8 \4 ?4 X3 B- D, Z" m
' C! V, b7 w: u7 ]3 X9 ?# s
3 N8 w' k4 `$ _0 n7 ~5 q
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
) ]1 r* h2 g+ @3 R1 q( W* D
6 `- M9 w2 p1 F; k: T. o
( C0 G2 y& [/ r! u; ?, e
  将数据粘贴进去

3 E. ]. E: p% D7 I& i( Q0 [
, |, E6 D9 S+ c
1 [$ ]/ {0 t/ G7 v+ e4 }. N' W
  软件即时生成的图如下图所示:
! [3 G3 O5 ^; l: |7 p; A

: T+ n& v7 x# r" k- h

0 s, W% x  P( _! p
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

' Q- D& x; Y$ J0 q6 V" F
2. 柱状图
2 u& P* O' I# L% L/ H; b
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

+ O1 N! y6 |" E$ M- N3 e
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

) y5 @. g1 S6 O
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

& z4 h2 R# ]; ]) h1 h; r: }; I
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

6 ^% [& J+ t2 q2 `. S  d

% Q" B! A. U) d6 F! r# P$ z4 Q5 g
; B( O( Z" C6 r, _5 g
在Data分栏中输入以下数据

: q( ~! }( X% m5 ]. }% p
& v: q/ N" I3 i

8 A% M! m! J$ d! ~/ i2 Q, \. M
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

' ~; l* M6 g$ M/ O8 i
0 r  r$ \' u: v. M  d! V5 R
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
" W, L$ p! f/ z6 z: P4 J- X
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
- q* b: z6 q3 ~- t3 U; Y2 R, N
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
5 g+ _8 P0 p0 A8 Z1 L. H
- v6 X: D* |( r0 N

2 ]9 s7 V- X7 Q( [" B
  在Data分栏中输入以下数据

2 c7 B7 Y4 O2 F6 x! I+ R# [" D

6 L& Q% b1 X- b8 y

3 Y; W, `6 h% k4 T" m6 k  U
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
9 F" B% T: k, f& K7 f  V6 W3 v3 y: J
! R' R$ ^# g, b* K
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
. [$ h5 U* `. \: s1 G6 f
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
) _( X6 ]  L* t0 R0 F+ x) Q. A
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
# d2 L( L) b5 c6 Y* I
! S' I) k' D0 ~( Z

: |6 N  f' e3 @! G5 @: k4 ^$ F
  软件及时生成柱状图,如下图

# U; j3 X- B! Q% f% R% r0 n  ~, O

5 m: V$ R% E$ [% J& J  h4 c8 A* K
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

! c; Y1 R% M* H: n# K: G
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
# A. d5 W& p" W' M& U" f
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
/ W0 E9 S' |! w
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

! k% }- ~, y1 E9 s7 z* f$ s
% s# V9 b/ a  F9 t, ]' M2 A
5 O; D9 R0 }: \1 X
在data栏中输入数据
8 W, v$ W6 H2 s8 e( c
% u/ i' \1 }: R. S3 s; _2 n

3 X2 T# \7 p: |2 P# O
软件即时生成的图如下图
( h( X+ Z, r. ~; s
8 t& L* ^  t7 Y! E$ O9 e- g

5 l6 o% F8 b  y: ^; O- \
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

9 V) `* n' z" x) n
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

! e+ ]4 h7 J% R/ j& d' f
3. 组合和导出图片

: c% Q1 d# Y/ ^2 v7 |2 S
点击layout栏,出现下图所示界面
% b2 v/ E) W, [- ]' {" b: k- c
9 ]6 ?. U4 b- |, H& C

) Y; D( @, W5 ]% h1 E
1 ?" R. K5 F4 n8 T! Y0 Y" v$ l* W
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

  v9 j8 F6 Z. A# k4 I* D8 k8 D' y6 }
; N; q& O9 x, C+ ?* [. H- g# a
( a+ P  ]/ Q2 I* ]7 F7 x" a- F
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

9 n/ `' ?5 E1 Z3 @3 V) Q
, j! G, [# r' O- n

" j+ J$ ]8 |4 x- _
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

# C# X! W) g, ?# t4 I9 j5 a. M

: r9 @* b. M0 R; d" U, v

5 o+ Z7 c% @: v2 ~" a$ T( U
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
. B0 ]# n: F$ A) n1 d- @! t. l

4 n! e, g% E" b- H) j* l" H

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

174

回帖

549

学分

1万

金币

论坛元老

积分
549
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!) n5 m: q! a; T4 F! _# W4 f
+ v1 T5 F1 T( c6 G; b+ \
- |0 n% ^4 U' ]0 Q! P4 Q$ m, S
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
! l2 O" r- z& q# Q% |: Q满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
% g2 O' O: e" n$ h& f4 R' j* P" r
刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

回帖

3

学分

463

金币

病毒学院小学生

积分
3
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|Archiver|手机版|小黑屋|中国病毒学论坛 |网站地图

GMT+8, 2026-6-6 04:31 , Processed in 0.059802 second(s), 27 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2025 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表