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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术
& M2 R" @8 y3 @7 g% O1 d; s' X
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
4 [% M* c: X( {1 T/ m0 {. R* ]( N
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
4 ?( \" Y9 L+ Q# m4 n- _
——正式开始——
3 h2 |5 T) x' c2 @2 R" O! H5 o
1. 折线图

, F9 A+ D- v2 _8 ~, C
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

; F6 T* i/ Y8 @
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

  d+ Q, S- C& y8 A: @) D
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
0 @1 {, ]; s! Z9 x
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

. L, G% r+ g% h- @& Y) u

7 N% u& [) ]1 Z8 ?

& v. N: W* B8 P& `
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
! ?. B; h4 S9 O; a$ K

3 [# q( c1 `  G# {) K

- P( {5 _3 r) d9 j1 ~
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

! l& `0 y2 O8 m+ r8 z3 R

; {: |# G& u' K: N
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

1 m! n3 x* e8 u8 `) c* _1 y" A

0 R$ J+ n7 d4 F8 A8 a8 r& I9 Z

' \3 r- u2 q: M1 z1 L$ x  M
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

3 J  o5 ~' M4 |9 s. Y/ z5 u7 Q7 d
' R" I  P  n( F7 ]- L
. D6 i) }0 {3 ?! a4 m6 O
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
( b1 |2 W0 w1 H* z. E5 F

  T' E. p6 V( }% Y* b$ T2 ^# R
' }, |( _% ^, ?& h5 ~6 V" n( a
  在Data栏中输入数据
- M8 X! R, N3 L3 E/ |- f

) C; i1 |# D. G
. _# f1 v3 `9 o3 n
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
( f) C: W) D$ _8 ~8 k$ P$ Q( `
5 ?0 [2 p; a7 |+ Z% c+ x& O

* b: l/ ^3 c7 W! @" K; Z0 s2 Q
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
$ X3 Q) g1 B+ Y" H) G$ t! x
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
! ~7 l/ u) a7 V0 l0 Z, L
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
0 j  Z0 u: R4 P8 X5 |1 i
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
. L. h/ G! r& n# a
+ X6 [. ~9 Y8 B# g7 z3 `
7 W! W/ ]$ L. |. n0 b) x
在data栏中粘贴数据,如下图
: ?9 V8 e: h3 C- ?8 p- _

- U/ g0 h7 P3 [6 M' @& T6 y7 n

8 d' ^( \+ Z* Q5 F: I" {
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
0 G# \  l) w' U, c5 @

: L, @' k! e* ^- v
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

0 _3 w' y4 `$ x& r% s3 v
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
: x8 `2 ?, z( b8 l: r' C9 ]/ [0 t& X6 W

  H7 E6 G: Y: K1 @, C- p

$ j/ o- I& M" h% O/ j' f
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
* \$ h8 B+ c* r" a! x

7 H# x. j( J& M$ m

# b6 |/ A; h9 c$ C% a8 [
  将数据粘贴进去

- n, v) N- _+ K! _  m  B+ z
; P, S' W3 n' I) B9 \
( n* C7 }1 }+ A* f( ]- b- x7 z
  软件即时生成的图如下图所示:
. t/ [6 p$ q8 f2 H
4 R. N% t) S' G

( P  d; \2 C# }6 \) t) ~
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
7 Y( u8 b6 C4 k5 q- I
2. 柱状图
" L/ ~% Y2 _  Q* y7 n# S8 g
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

  n% B9 g0 Z3 n- ?4 [# H2 o
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
* L% h5 r0 A& L  f& \: G4 O
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

! l% @$ }3 }; ?$ O; b3 }- ?1 o0 `
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
: B' T* z# y+ [0 b1 B/ |

. f1 w0 f# d. S. }" M
! Z8 D: \# _" D, k
在Data分栏中输入以下数据
8 V3 @* f  Q/ s0 v% q* g
& k- z6 I, h0 f6 O$ Z

" B3 M- w/ I" ^/ k4 B; y
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
- a1 m2 c% L% d! J5 _. @

6 y! i- s5 a# C& x
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
3 `1 |0 e9 F3 P3 D
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

1 ]/ p6 f- S7 a8 W
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
" W4 Z7 \# U, F1 m# `

$ ], h! z! A6 S# f9 L, ?- x
  [/ v) x7 v( ?# u
  在Data分栏中输入以下数据

( d, D3 o3 ^) n

. A, R' p, d; }6 |

) N+ S5 A: V( p* m' x; |4 u
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

% a, t! r% W6 D6 I. {* y6 J

! S* F" t1 q" J) ]' X5 w% c( ~
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
5 J& O0 v' |( V1 v6 A
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

8 W9 k) \5 J" @
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

+ Y8 `$ ^" W4 k  U7 B( ^# c
2 [! W& o1 O# l

% m( @4 F* f6 k) h% l
  软件及时生成柱状图,如下图

$ f7 p9 u4 [( A$ x9 S" ?
, p  A; E8 P1 |" `: V
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

# D5 o+ E# y) E7 g( Q# V2 g: o
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

$ k9 d" v/ T+ g7 R7 O
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
4 L2 M) H4 V: z0 f3 X
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
# s% Q- u6 ^% L
- Z" @4 W, ]% M. B

# @- N/ X. W& S$ _
在data栏中输入数据
) j! y% I3 W8 N& ^0 w4 `+ U' Y% b! h0 \

& {( [' Y  W+ v+ C
9 I$ Z$ E, [; P/ ?& w- n
软件即时生成的图如下图

- e0 O& U+ T, l( U) o1 C

1 Z& \5 Z2 i) z) Y6 T" Y8 w6 v$ B+ K  E' c
) `9 q/ {$ X2 ?8 A# }6 O1 r
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
* R' V- d$ n0 ]7 {8 F& Z
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
& K6 N& }. D% {) h3 L- [& T
3. 组合和导出图片
$ x' O" l( v. M4 `2 R
点击layout栏,出现下图所示界面

: G; B6 r4 Y2 e' @0 b% r

7 F! q" ~/ G# D0 _: W8 Q  `2 U3 T
, C  E& C; Q8 g

! B8 Z. Q* w" d/ Q
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
+ \- N  Z$ B6 H" f7 ~

- @/ `! g) g1 k. l3 c" C" H

! [' l8 n1 S! d! b! M) n3 y
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

( c1 [& O8 \* v, p4 _1 m' T4 c! r
( W5 e5 c7 ]; Y. P% k

: f+ F! R( C8 `9 H  \. q2 x
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
( K: h% e3 g7 n9 r3 v, S/ O: t
0 {8 e% s. H. X/ T2 h7 f

2 G# ^. D* h- H) ^5 p8 p$ y
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

; `) k1 `. D6 g5 m3 S4 d9 I
" C- I8 W! D% \* a! r  ]

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!0 k2 B9 R) |  n, f; r9 [8 H
2 w6 @; T3 G2 P+ n. M. q, w
, P6 W6 N: p" _! \+ L7 h6 A
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
. S! }5 M7 o8 i满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
) B% |3 }. K0 l; U7 V, t5 P0 b
刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

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病毒学院小学生

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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