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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术

+ ~6 l' m% Z; z$ `2 z5 l
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

" u' M" d' ^, a. W
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

$ f; w/ h; J, p$ j5 N- |. g
——正式开始——

! Y% E) E$ e) m% H
1. 折线图

& I7 h4 s( j6 ~- {1 P! r
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

; C' m/ `' v( w$ H9 p/ O% F
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
& g% N7 f3 q; d+ Z* @5 A
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
6 o5 @: @9 A5 p( {5 d+ O# T5 l& _! D
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

/ j3 T8 W4 v9 T5 \
! F# N9 u, f, C2 L- q# T' @/ V, K5 \
+ {. [7 G- ^% R7 h, ^. Q1 p
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
8 P* F6 d$ u* E( C8 V

2 l7 @- p* P& ^. A% D5 L0 p8 b# b

% B6 Y( B( {" [6 ~' P
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

, X# g- r2 M6 r) g9 r

" p- f# ?$ y) w; `/ p6 |
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

3 n; C" b+ e" `3 U6 G

1 M" D. A' Y. T5 y. ]
7 n- G5 t! U$ z8 [7 b, q
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
7 @1 I8 C5 V$ X7 a
2 R5 [5 X( t8 O

' H" a5 t' i! Q, e) ?2 D
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

" r2 `. D) K7 N6 G" G3 w/ N( i* R9 g

9 h& d4 N. C9 b1 Q, M

' T/ I' F! I/ ~  O4 G4 G
  在Data栏中输入数据

' e! g, Q+ m& Z- |5 E/ i' W" B# b

4 c1 H% g1 v/ E
! V% ]. i/ {8 C+ q( D
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
5 J: S; T) F8 W3 h! P, k

/ w3 D) c/ L3 K% f( }8 E( D
# Q. E5 m: ?9 X; z6 ?& B+ y( Y& z
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
7 h2 V1 J- ~& K
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

  u- E0 X+ p! h- K' z4 x) ?( Q
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

8 h* f% `2 Z/ V8 q7 K0 U
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
# Y' ?" ^( Y9 d
5 c; u) ^3 z* p6 t
( H7 w$ I/ @5 i
在data栏中粘贴数据,如下图
( g& L' {' A$ g' p5 }; a9 [2 Y, H

0 m" `/ @( i: b4 ?/ {$ B3 c2 z1 e1 r

9 A  a/ n0 j+ D% H+ j3 G) A& ^
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

( Z: r$ ?, b0 J% j2 z8 [  m
$ T. `% l  `6 a/ l% \
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

0 ^7 t. r# Z5 L( e7 `% U3 W8 F
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
% Q0 v& G: V! O5 s" y4 S, ?6 \& T. U
- p. R# W! ~" Z! L; t: C' I$ M
4 }( B; [$ v/ T
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
% C! E$ t' U$ w5 m( h6 J9 Z
0 R# K) O) s8 f  g

2 `' ?! i9 F" c9 A& t
  将数据粘贴进去

" P# }% J- q$ H  ~% l; h/ A3 q

/ u1 z6 s# d1 Y: t; s! ~+ Y

) A7 Y$ q2 C6 m' L" F
  软件即时生成的图如下图所示:

/ }# \& L7 [9 h4 H8 L" W
; k0 q  i# I2 w* Y1 W% B
5 X3 H3 L8 j8 `. ?( X% ~/ |
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
, R1 j/ g) y1 y  c8 p& A3 s! k8 {
2. 柱状图
& K# L! V1 v2 z5 C* G
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
& i. q) J2 K( L( }: p+ @
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

9 Q4 ?3 K1 A2 a- Q! [4 A7 D" r, t. |
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
( m7 Z& s$ ~5 }
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
: t+ _. v5 l- ^/ i1 t8 P! n; R

' t% X; W/ y6 m6 g2 N& s7 }8 ~0 @
1 H5 F. g1 O' {
在Data分栏中输入以下数据

  L; g1 W9 G0 U% U

) T: ^! _. I1 }5 c3 W2 `
; m, b- i" e& V
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

, z- h0 ?7 m9 {; N: j1 ]' b+ L
4 W7 Z( k( w) o% K5 x8 y
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

5 R/ t) C, A. ~
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

: f  d3 v' C0 n* x) w. ]) a
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
  |5 G8 l% A/ Q0 j- j' I0 P
- V0 @# l+ r8 d

" e1 {# e8 p8 n+ W5 U
  在Data分栏中输入以下数据

- `4 s3 C/ a& l( x9 n5 v2 w! T% @4 n
9 N! P- g2 b5 q4 G4 z
( z: o( |% X( S. v: ?% Z# z
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

4 @8 n" W& F# l% g# Q8 q9 X2 V. r

$ O8 Q; \" K. u6 `+ j1 z; N
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
4 X% a0 e' D3 G; \- X
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
  g* i9 ~5 ~4 {% c5 Y
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
* j. E  ?& p, F1 X/ E6 n

* \& l* J) V* E, m
/ x% V# F: l: R- t, A3 H' L
  软件及时生成柱状图,如下图

3 [& _* E) l& |) m/ z$ k" o
" _0 X+ B. b% K8 Z# \- D
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
0 [1 x* a" |) j4 e' u, W. S' k7 }
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

& p9 P7 t9 C9 N% F" N4 L* r
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

1 \! A3 F' C; o, I# S. o/ A) I
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
3 R1 k$ `4 @& \# \" U% d
9 B! N) K9 x/ [* U
8 `# p4 b" ~0 _1 R( y
在data栏中输入数据

2 S8 y% P& w9 Z

& j" r8 o! S6 y
, ^6 E( e4 b, T6 y; `! n
软件即时生成的图如下图
) V: [  d0 Q. e# K( g+ d4 L3 [
5 ^9 {% J# h1 u/ e+ M* {

0 U. o& l' d/ F4 b+ y; I0 W8 x5 a
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

- _, ~, Q$ E! K. V: B3 Z4 T
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

& o/ v8 @0 ?% k1 C7 S" J
3. 组合和导出图片
# {6 l$ h, @' p7 n& C6 Q) C
点击layout栏,出现下图所示界面
' ?; l- [. i. n6 _/ i4 s# t' q

! P- @' W5 t/ P* e/ x' o2 w
  p2 N3 `1 b2 o

& n4 \1 o3 \$ |9 `2 q. P9 D4 R
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
4 T1 ^- I6 q# e) Y

7 _! o- v6 _  R+ R3 ?+ L1 f' [

9 G3 c- }6 Y9 p
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

$ N/ F- F0 {! C1 h

1 G- H7 o8 m# b7 R5 m

9 e; p/ G6 G. z" _* R" m8 G9 F
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
: u' j# @) b* ]% r. u, n4 P
7 q5 K3 x9 e: {6 Y- t" Z$ l9 }

- u" H% p$ b4 d+ F% o6 ~
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
* r  z# y3 n8 n2 \

( O8 \8 u( h3 Y! h2 }& z

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
8 x/ i9 s! C5 G3 c  E' {- [" R
. H; N) {/ ^8 J; {) Y# J8 P+ z- s
# O: |/ j1 r# G/ Y3 b$ W( r比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:126 E2 v  N+ V: b$ U* R" w% D& U
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

% |7 P0 D7 i) _% y& P刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

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病毒学院小学生

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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