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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术

* H/ ?3 T3 H' p) Z) g' |
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
& w5 x; e# J# \2 b6 F5 K- I
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
7 v& d! A, i* D! o" e- p  ]
——正式开始——

4 I0 r0 b2 O  K1 A. l
1. 折线图
1 J6 ?( `% g: `9 i
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
  y1 i9 T% Z3 w/ G9 c
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
: S' v  j) _$ p) S1 W! j; ~: R
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
7 G! i6 S2 }: e1 H/ q& u2 j% _& ~
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
8 f: S, D3 l) K0 D! k/ c
0 |2 j; S% e6 j. @4 x$ z
/ t' y' a0 Z  n5 n* {& u
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
  A% W( g, w3 }& Z

: s2 o. c6 N" H

7 u9 W1 B+ o+ Q) Y
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
6 F, w4 ?9 g' H  W1 T/ C
+ k: O" o1 E. l1 s, ?; G: }$ \
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
! T  J/ t  x3 ], z% C7 c

5 }) U7 Q2 c, \3 ^) H2 S" t; ?3 S

% V/ s% U- q( i2 K+ ]
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
8 k- }9 H0 |3 |7 Y% H

& D  I$ g2 i% Q4 f+ {
5 [8 C4 r( k) U, L7 Q
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
  B$ W% @  v2 P& ^

$ e7 K6 W! @8 t' ?( \; Q
* V. ]# d; T# _
  在Data栏中输入数据
0 x2 @1 N7 m/ M: j9 E0 O
1 d9 e3 ]) C# @3 Y8 B
  y+ r1 s. B  R+ J5 X
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
& X" j/ C  {) j# Y% R, W

, l/ t" ^& a# z# {7 Y

1 C, R! p0 _* C# S. W+ W
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
! r5 N5 p$ I# l3 @
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
7 z1 r; H3 ]% s; |* C8 w* `, L
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
$ Z) d3 ?4 ~3 @+ R# U
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

1 R9 Q  a6 R, a& w

/ h5 H6 t) M. G# ?
- I+ r  [+ o& K8 u, t0 W( g1 _: E' w, J
在data栏中粘贴数据,如下图

0 T* F. h' c9 h3 g. N: K/ _# R

6 P* I/ T) L( Y" }6 v% M: \' o
6 t. ]1 r; b7 k$ x, ?) m2 d1 B: @, q
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
8 ~; C7 p4 E9 c& |: ~. x: c

$ }4 [; y" b2 j( J1 }7 j$ b. [
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

& X$ h; a3 D6 _: o# W: C/ x: \. q
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

% x4 Z4 Q+ a7 N- \/ e9 M
5 Q: ^" R% \) X3 G/ h( a5 \4 _0 U& T
" T: X9 a# O$ i$ y
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
4 W% E: X! T+ [5 F3 s- f( N

7 X( |" e- I6 y9 l1 o4 T7 \
3 V% [3 w: E, ?- A
  将数据粘贴进去
& _8 }, y. T& @* O. R0 w1 y) M

+ E, ^) y) ^! ~0 z! J" b: D
2 Z6 K, o) J* J$ _6 |; |# q
  软件即时生成的图如下图所示:

8 z8 a+ c( s! [# ^! |( W# w

1 |6 G% P3 M2 {: O: Y! y5 p. z9 b

) L7 l4 e8 {3 J$ u; o
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

9 ~0 j$ r: I5 W/ A1 E9 e, v
2. 柱状图
( b6 y/ k% L6 z( V& y; U- L
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

, G! X  M' d; @0 U# N0 x' w7 `; N
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

6 B( P# q% \. l  b& j
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
. d/ O) j7 B7 s2 T- j
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

- u$ b4 \/ Y5 y! |3 A& @8 A/ K
& g6 k5 P% C  O4 ~5 E

& x: n3 j0 P5 e$ ?! V
在Data分栏中输入以下数据
) t3 Z; Z9 x3 S$ I6 c

7 _8 Y1 `9 ]3 [8 Y; ^
# n; n# }$ Q8 o" _  K
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
) s" ?" w0 ]  [1 W7 L* b  i
  m: ]) @& o* z) |  |
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

+ \6 {+ C8 r8 D- D
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

' M5 k3 e; x' v4 I$ S$ d( ~
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

- a- @% q4 J1 k& a% E4 F
+ k% ^. B" g+ F6 d" B% x( ^
, s! |( c+ F, i7 B: ?5 A9 |
  在Data分栏中输入以下数据
% h' m: t& x" ?$ K  Q0 b

! p/ t: g) ~4 y: T- `. E; R

- {$ u% v' k' P8 D2 {
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
  ^' a4 j9 M- }/ k  m
. U3 y2 A* Y4 ~6 w9 F3 n% |
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

3 O: K) q! d" D$ p- D1 W2 j3 V
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

4 y3 _9 ]- a* G7 o7 {
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

- b- ]' R( l3 m+ @' X: i

% X& n# Y1 J6 _6 l8 k
2 K* B( g4 K8 U" O- i% W% ~! N
  软件及时生成柱状图,如下图
; Q: [* h7 d6 Z+ n  |
" n( g+ Q: n& l  C/ W/ j6 r
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
( V6 A7 V+ ]+ u2 x- d6 N
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
+ ~7 B' B$ o9 T) r% B; `' Q) d1 r
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
' F- b1 D# l$ f% D0 y4 @8 T. Z
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

1 s: \' o" Y  F

$ k/ U  a  }6 h5 s  C4 N
3 m/ D" n# t5 G
在data栏中输入数据

1 ]. E; y7 x$ s- [

3 U0 y# a$ L  A) k  b1 A3 [
' y2 N4 @% B! l- l. V% S0 B
软件即时生成的图如下图
" O2 N7 _7 p* B7 d$ D5 R6 R+ z% F: W: G

; L1 U7 B5 O* B
1 {; n# Q1 x& T  ?' Z! W
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

% i6 A5 X* X  `+ c( p
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

9 w6 n  s7 R4 }  e
3. 组合和导出图片

; a2 Q6 B9 Y. C) z# i/ _) H
点击layout栏,出现下图所示界面
6 @) g8 n- {3 K; U, [0 W

% W; _7 ~8 t0 f

% |* n7 ~. p, u8 C7 P
! P+ `# Y  o  D7 y- Z  }
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

& D- a8 m0 p/ t: ^

$ I, L  l1 `4 j
! T5 n, {/ _1 V" p* N
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
+ B- L$ ]. d; b5 ?2 j- x) |$ {! Y
. i. F  g/ `- `; D1 t

7 _0 i" _  S1 |- _: W/ W  o
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
4 t4 ^- R$ n5 V' _, b7 e* }
0 ~: B. Q% f9 J* H! m, O
8 d1 r: c; r9 E5 W8 U# ]. J
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

+ f, R! m# o- W( u: m1 v" Q$ ]
* M0 {3 W: l! W, m$ N  z. ]8 {

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!4 |9 S1 f* W" [/ C
7 v( x% p/ O) P3 e2 F: r. k

- x6 |( G  u2 @比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:122 @7 ~, i4 G; ^  x
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

) I! ~0 T, \% j1 e' P7 h刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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