找回密码
 立即注册

QQ登录

只需一步,快速开始

搜索
热搜: 活动 交友 discuz
查看: 4319|回复: 4

如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

[复制链接]

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术

' E% ]: s5 _* l  u
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

# ^. ^, O0 Q' V( H5 \
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

1 Q- R5 P. L% B5 ~( g- x. ~
——正式开始——

: @3 I. j& _, Y# G8 U/ H# l, L: W
1. 折线图

% ~9 p: R* H9 v. y3 F
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
- _, g( ?+ [) `3 n
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
" I2 M9 n2 @$ w0 B
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

7 o5 _, u4 M& B2 R2 {. j- [
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
% o8 y$ ~* A, z/ w  `) ]; z
6 p4 x. l- I% z
! z; Y& N. O# p- w1 T
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

+ h. P! |% j% j, P% s

; ^0 o, ^2 t- E$ q0 U3 n$ N

3 }5 n5 G8 N, X  G0 z4 x5 S
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
' i' X: m0 U# L
% ?/ y( K/ Z. {& f5 A5 R% W
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
; }  c& G+ d: d  d

8 `; R7 U  L# \+ q

; ~0 t6 b- ?1 ]6 Q! F. t) h# e
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

; c$ ^  V8 C1 Z3 A8 D

; v1 `0 l8 Z! F& n3 F( N' P

" E. H2 m! l: @
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

8 ?! j$ F9 {! o

/ m9 j7 E$ ]0 [7 E
) W0 S+ q: q1 J: l3 c
  在Data栏中输入数据
& U6 Y: U2 `' F5 s% `

3 K0 v4 u( b  z
- ]" V/ J4 U  u3 U/ F+ d9 G
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
4 v/ ]$ ?! \! B; {  R& k

# t! ^1 N3 v, B, S7 f8 S

( i7 z1 d1 H- P2 F1 s4 e
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
: A% l# X8 V5 s& R: k: B: T( X; u
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
& a) W6 l) G3 p
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

% X9 Z( J0 P% C) d3 K
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

1 S# A( L7 S5 Y- Y4 C8 p
4 p, |3 a4 z- t& w0 `' m
( G  ^( Q# c" ~% _6 ]
在data栏中粘贴数据,如下图
8 \* c, F& L9 H7 H( K0 Y% s

# @$ x: R$ m2 M/ X
' v: D" v* H' p! R6 r
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
. z% I/ S" q; V! R$ q' i

* x6 |# j$ F( ?/ X2 @
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

5 ~* j( F* ?. h  r3 O, l" m
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
' N! q1 C7 q$ u& W: {* R
9 d  B. V& k; V9 @

: V0 ]+ F, {; I
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
9 g+ c9 e* ~% g$ W6 D
% C2 u4 X9 l2 T) W% j
& x. D  l2 d, [
  将数据粘贴进去

/ j6 E$ f* |. S3 [3 ~
6 o3 {. W. H% U' \3 w* D$ T: @

/ E& `) {* \" ?$ T% h6 G
  软件即时生成的图如下图所示:

8 o! O; J# B- Q5 f
* l8 X  {7 C, w( y) @

4 P# [, K5 p1 y; ]: J6 d, g
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

, D- N' I/ q6 f+ I9 x" p
2. 柱状图

/ ?/ c& A: j! O8 F, A1 q0 Y6 U. |
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
% p* \9 @* {  O
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
* H; X* }) Y& z; A) ~. F
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

1 U) O0 i# O- |6 [
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

2 v+ K" g3 h5 z7 v6 s" x$ s

5 L: n, u+ H/ C( ?9 r

) r/ x& g' R6 D% f% G
在Data分栏中输入以下数据
6 Z* |8 h8 `( I: @7 T3 B
9 f0 d2 c. X1 r. W1 J

$ p, `+ i0 k, o3 {) [# K
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
( E% j9 k8 m" M* R3 ?
, K2 E9 |! n6 @1 g% `) d' S: v
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

" y9 |0 J; O+ a8 Q" z
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

/ C" u3 @7 n( ?9 z: t
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

  ~9 H4 z: Z8 P+ v% J
/ U8 _1 f; O4 w# d2 ~
8 T0 l8 L$ N# Z# J) A* Z  Y8 y
  在Data分栏中输入以下数据
$ ~+ |# f3 `% M9 C

& c, a% m" e  y4 p7 K, b
! p* k" t/ M  v: y! e' z. N
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

8 g& X9 g0 k7 P2 j( j
4 W2 @% K) h0 M* L) Z2 z' L% }7 ]9 p0 q
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

$ ]- j2 c7 H) X
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
/ f4 K& y% O/ ^7 l4 F& j9 d
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
5 P- n+ U9 |7 j# w  I, s

2 [. m- j2 ?. Z( S0 i

, T: Y* N9 L2 ?* K! W% B
  软件及时生成柱状图,如下图
0 h7 ^+ f' A# H! C6 V
& N% c6 h4 E1 S5 [
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
$ |0 c2 k8 i! b/ O# N2 y" y; E
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
; F) _! G$ m; {- L, ^: Z/ n
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
% F; S4 r' l1 H% r2 W
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

1 h* s7 `5 c/ W$ @7 @6 u: }6 M$ ]
5 K, u( V3 [& r! @, j: ~" Z! }+ _; S
3 F& c+ y& r1 B4 e/ T
在data栏中输入数据

  F4 {7 o  m% C. f* M

! N  \0 r. ]( C! D

- k5 q# \5 f7 o
软件即时生成的图如下图
$ E6 `% x- W5 i

& G. }5 N$ f, ^! P8 f
3 t  U) p  s6 g7 I% }
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
+ c9 E7 a. T! A, U- I" u7 T
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

% `) h; i& ~- f/ U6 b3 r0 |
3. 组合和导出图片

: ]3 L! e! e; s/ A3 P# V) W
点击layout栏,出现下图所示界面

7 j8 e  M7 B8 h2 f) z" G3 P8 H
" Q" D) M; a5 x) B$ R
1 U. z  P, o9 `8 f+ N: W
( Y( ~: t; F: _5 i, S+ j/ i. Y. f9 `
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
  {' Y9 B4 }# w: T: r

9 C2 v4 E$ @4 H# S( A( P

8 k: q) k5 l* a2 \
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

6 D# I- E; ]) P: S* l; M+ s2 ]
/ z* O8 R- Z. m" T, x5 K
/ w3 U* Z' S- L6 }- _
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

1 o( P' z# \3 u2 M0 ^! F
9 y3 @1 i. d' u+ h+ P/ h

: p/ J  v# {4 V6 A) v2 |
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

' y# B9 X. p3 [3 Y! y# H3 M
9 a- u8 N$ S& j, q: z2 y$ ]1 ~

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

174

回帖

549

学分

1万

金币

论坛元老

积分
549
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!  W% e# e. P4 B

2 y8 @2 _# o  F+ a4 A( i7 d3 J% p* j
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12! O7 Y; L) {$ Y& _4 l
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

! H2 R7 H' X  v0 D+ S: o刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

回帖

3

学分

463

金币

病毒学院小学生

积分
3
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|Archiver|手机版|小黑屋|中国病毒学论坛 |网站地图

GMT+8, 2026-10-22 13:13 , Processed in 0.151479 second(s), 27 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2025 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表