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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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论坛元老

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楼主
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |正序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术
8 I7 @% k; I6 ^6 }6 w& T/ i" l
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
" Y+ j5 n7 a3 V# ?
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

+ p! ^# D; r3 M  P9 N1 Z: W
——正式开始——

' _- _: Y9 X0 S# |' h. {9 g
1. 折线图

3 A% `+ C: P- u+ f0 P) r& N
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

0 k8 k' S8 R5 [; e# ?' N; K
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
; `/ g9 {9 X+ I2 R1 T
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
1 s1 m4 e' |# T0 g8 j6 S
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

% F, N4 |5 x, B0 s3 l+ f
% Q5 }! a2 {: G* x

& I6 G# w5 S; @* z
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

) u9 q3 O: P3 _- E/ z8 a: K
/ B4 b0 p. H+ @- g8 ?8 Y4 o4 _4 q
2 `% y- E; e+ I. J& Z* \1 i8 V
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

; C7 [* p5 c3 V' \1 T% z9 D# g
* N/ Y$ i9 D1 z- C. [
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

( r. h7 i4 ~' F- V# J

0 G+ l1 ?( @8 {, H: y

, o: M+ S( i6 I& a  O8 Q
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

( r3 P1 R- y- J7 L, e

8 n  y% F. s3 y0 d& A) D2 H8 A2 Q
, l) v# H" Z$ ^+ O0 B
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
2 S: b; R8 E1 c' _( i2 N: b
+ P/ W9 m. T/ A3 }& a+ R& o- O

8 j* g& o! z( a3 H* Z; [  Z+ A
  在Data栏中输入数据

9 E# O, `* l- n+ i8 W
# {! ~7 N: R& t% S- S/ s" `

% }1 ?0 G8 Q' j2 s% l9 e5 F
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

" }5 `. @% b; K+ q% [8 i# x
. X) M! i7 I. z4 \

0 Q6 T1 E: }8 J$ y4 [  a6 O$ ?5 j& R8 F
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
4 Y' L; T- ]1 G
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
+ b/ C* u$ Q5 o$ m1 K7 P
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
, C" ?: o! A+ I! {5 m
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

& K' K" k; q" p8 H: m" F& d
  _* D& U5 h8 Q: A

* H* r- I; Y( C! Y5 N; W( C; k$ b
在data栏中粘贴数据,如下图

6 h' l: c' E$ ?, m

2 d0 d2 d7 I/ `$ R

0 a$ u9 K3 o: Q$ Y1 s: D
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
$ y& P  c3 G" U
) Y4 T7 J9 h+ T( o; p5 J
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

6 ^) G/ b0 X7 L/ T
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

! y# P+ A3 Z( B' z. O+ r
3 b' Z. D' k2 V) y& w" _

4 D* H& I; O) [7 h; v' |
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
- d& r) g, m) M. k7 Z+ A7 m  ^- i
& `# s8 n% {  |* S$ {
6 p0 N( U. G' v5 q# C8 f; F- z$ K
  将数据粘贴进去

0 |) Q6 Y0 [! a% y. w

! v& _. h; b# s' J% B- j1 `
0 D- E# p+ |7 Q, c
  软件即时生成的图如下图所示:

7 t; K3 ?# M) i

5 v; F$ y# I0 S( X: j$ D
1 d8 B1 `3 T4 @- ^3 s% x. M0 ^) l% {
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

$ |4 S% v4 ~4 I: W' U+ E
2. 柱状图

+ J+ G0 m, |2 Y' {% J3 S; A% W2 s; M
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

# Q4 n: h# Y) p$ T
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

# X, d& e( o6 u8 F3 v5 [( ?+ j
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
" n, y! H! }/ n8 V" L4 U- K
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

0 s5 [$ w" K( r5 s' y( S. K
+ T. _2 x% E6 g7 ?% b& o
' |) m) c- H* @1 a
在Data分栏中输入以下数据

* d! ^& D/ e4 P' }, v2 U6 j" w( r

1 z  x2 X* W, ^' e

6 H& l, z4 o7 z- \4 w& q  h+ R
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
4 b, l$ N/ R8 k% f
+ t' l5 g) J( H: j, E& P
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
$ L+ {1 X* g6 C. M% S
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

6 d2 ?- }+ e/ u! A8 ]- L
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
; J0 f# m% ~+ \2 M% X

8 `: x+ c' F* b2 T) U

' Z+ }2 x; b7 q/ e) c, d
  在Data分栏中输入以下数据
1 ^/ P& P6 D; ^! |! Q& e8 j$ B( z

# e1 ]& |1 s/ u8 O; Y; w, Z

) J+ |& P# c3 R  {" d
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

! T: E1 x5 X$ `5 [

& c( @3 w/ C% w  z
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
* a( n) e6 m  y; d8 q
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
/ G' m! Y( ~' l6 H
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
/ ]/ y5 @3 D2 T: \5 w& j, Q

+ o. Y2 {; z) M* F. p

5 @3 `/ L  J" ?  g- w% i( D) w
  软件及时生成柱状图,如下图
, A- L# `( I* A4 Y+ [
5 t7 p8 K. p6 t4 ?# G
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

9 ^$ L% \/ W* e7 t2 C4 }
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
  o+ l* R& B6 q
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

7 C) g9 q' k& k7 b5 ?% n
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
; d1 z$ e( a* ?0 t
7 U( M8 G! r4 x) j4 ^% m

! H" K# u1 a  g! @4 T; q
在data栏中输入数据

: `, \8 o- N  _2 l% D4 ^

9 I; t4 t6 Q  z
' O9 x: N3 J+ F# P+ p
软件即时生成的图如下图
5 ]+ l5 g9 r- m# Z$ O4 o

! ?, f# x: @6 n5 Z& R* ^, K
, H, l0 {) ~  o6 T+ [: R
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

$ q. b7 K) @) b' ~
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
0 B$ }& E( @8 i" T1 T& c$ O" x3 ?
3. 组合和导出图片
: U( a6 W5 e, q6 V  G, l& L
点击layout栏,出现下图所示界面
# r6 o1 p/ ?$ H! `; L/ U  @

' N4 i4 Y6 F. j
- x% J7 _- d! x4 E7 Y) P: y5 O2 y
" H8 X" F8 W) x4 W& b+ g
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

+ p- D+ R" Y& D* l6 z! \* V& M

% v" T* K4 Y6 G7 h

! i$ r. A) \8 [( K! s7 W
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

9 n' s$ v" [$ |& q/ Y
; Q' {- `' E( K4 V
' Y7 l6 N& c1 i& m* C, C$ c( u
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
/ Z% |; N8 V* B3 H6 h

! p5 A0 y# j- a8 x  ]
1 M) `4 x  ^* Q: Q
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
  I' G0 I. }! [" f- N5 o' R4 t/ m% g

0 j( L0 }% l5 ?5 J. }
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病毒学院小学生

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!

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论坛元老

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地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
2 F+ @% M) K1 S满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

: b& H! f* e& P' d& J刚好微信圈有这个,就转过来了。

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
提示: 作者被禁止或删除 内容自动屏蔽

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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。
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