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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术

0 U4 ?5 V" l. Z; m0 ?; a
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

/ E( G! a4 l' j2 P8 e6 b# m! Z
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

! d, ]# F$ s( s) |( A3 `
——正式开始——
# M! I' V( ~# e! A
1. 折线图

+ V3 O5 K7 l5 `1 H' i- [8 E
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

! f! [+ X% P4 a8 Y4 ~' I) A' ^" s/ T
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
' S; e# M& m' I' F4 T$ ~
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

; H, R2 c' I/ y% Z1 n: L% P
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
9 h; `+ A+ q0 j' G

0 |& U7 A, g" z. R

6 W3 k8 S% z; I4 \1 ~8 o
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

# ~0 \1 e" s+ a6 p% F. j

7 Z# K* M4 I! r9 u
( u" S( V5 D2 l0 |/ `- ~
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

. J5 @/ x0 M, q% ~( V
. J1 K  q" V8 }& j/ g
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
" c: ]* ]8 `8 f: l0 |
0 E+ U; k2 B- o$ I5 p7 X

! Z" u4 K0 C4 |+ t% S- z3 e
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
  e3 e% Q9 }, M, d2 Z8 }

' U. j& f8 Q) k/ z4 s" c
* l% U3 z* R/ t3 E* d
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

# Y& A: A3 G) ]  g" t
4 S2 L4 P* p8 e

- F2 x3 w5 [8 @) h: j
  在Data栏中输入数据

% x: ?% o" V' I" n% I5 X+ E1 l
2 |: z3 Z, Q! I* E+ s

" ?* N4 p& f' ]$ l5 T3 W
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

% @. j' c% }' P( y( E3 s5 k  N( C* X4 \

4 o. M/ e. W. k& u: o
4 t7 H, j: E4 H  `- M1 X$ B
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
: Z& e; B9 G7 D5 I, Z
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

% N# |% X+ k* `' Z- ^" u
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

$ x5 q% C( x' o$ z& }9 a5 e
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

; l3 C& h& Y. D8 y0 ]# q% z' ~2 D

% V- x- h( P' P& w. V
& Y( E' L6 Q( H. Z
在data栏中粘贴数据,如下图

" B3 v6 `0 X& v! j$ G
! [- t8 Z8 z3 U5 M0 X$ n$ S
" A) [$ a  V% H% r4 C' Y8 i& x
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

3 q# `' ]' q4 m7 J! ]/ b% _) J

% M2 M9 F7 z& W4 U: y* Y& Z  K
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

5 i  X5 Q" r; f/ B% Y( w; e) w2 o
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

8 J$ r' b- P, j1 H5 B4 y2 p

8 n' d# \# r' I* T9 a1 k
3 K6 E9 O% q$ D! e# T* U* C4 g5 m
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

7 c" A' F6 h" [% x2 H

; f1 R- \1 G6 x) M2 C# i
& J$ @- J: T* m, l1 U/ V: {* L
  将数据粘贴进去
4 C8 Y) ^9 `+ G. |3 X
4 K# G# f$ @# i. @! E
( ?( Y0 S1 I1 B( x6 x! U8 A% ]
  软件即时生成的图如下图所示:

9 }! d# z2 y! x
+ y2 B! S2 P9 Z( X" j9 B
/ I( Q' t( i$ V
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
5 v6 S' S) C# i# Z
2. 柱状图

( F6 ~) f- `) ^, R
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
* X6 _/ f1 @1 g. ^4 G3 {# z( `+ D
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

1 ?4 G: S$ M& n7 e% S5 n
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

6 e6 |' R( x" M) n
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
* @& r# _' T2 M/ n3 |5 w0 ~2 U

. [/ m& l$ w; H+ d( _7 [

) A1 v  f( W, k- p* D3 F
在Data分栏中输入以下数据
4 ^! K2 V* C9 I4 L$ m

6 T) y2 [0 t! U6 J7 j

/ y- ]+ S( G# @  L
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
) n+ A: R4 ]8 P; h0 y  M# H4 T$ E7 ?1 t

, U/ k8 ?% [/ I2 n! D
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
8 ^4 B2 J1 ~9 q4 W& ^5 Z4 `4 y
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

% m- n% r0 c  |$ j  b( N6 f1 Y4 b
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

' d, J  \- C: e  R- j8 D+ \
$ k( u# ]6 Y& T) O) L" u
7 ]% c( i0 _7 Z% w! w' @( u  H
  在Data分栏中输入以下数据

1 ?* z4 G2 o9 K5 w4 ?
, j) \) l# C* A0 ~0 {6 Y

$ M; B' U. F" }5 l; {
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

& h2 l1 K- P7 K$ E( I+ A! X
: w. ]2 `  _0 M6 C- j" ~
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

* y( d0 \$ w0 ^4 |
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
9 w# W, r" X7 F9 P
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
5 }. {  ]7 i/ z+ T
, w% g$ f$ G8 a

9 ~  R6 ^5 t$ _! Z4 P
  软件及时生成柱状图,如下图
  |3 z/ b& G- l! y1 f2 U

, o- x+ t1 }/ A' K
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
: W) p& P7 |. i  w
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

7 s" m0 @3 f/ O, T9 E6 T) b$ D
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

; S- }1 p5 J0 i) t& ~
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
2 I, H7 B! g% L# V
* S4 g+ q) a9 x# D1 ?* b

' l0 {$ a& j4 N
在data栏中输入数据
7 B! L. g/ s. V& d
; o! Z/ j+ U6 X' W/ q
- g! i. R- X6 y# B* ]" |7 g
软件即时生成的图如下图

' g, G, c* ?3 U1 x1 p3 E
& a. O! ^$ Z! s" P
; Q% \6 E4 H9 G$ }/ v# J
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

% x' G( w) q; R" r' Z7 b% F
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

) i# t$ O- b+ U
3. 组合和导出图片
8 T! c. f" A' H/ Y
点击layout栏,出现下图所示界面

. @' R1 A- \( K% W& x5 ]
' W8 f# ?* U, l; ^

) f" S- ^. R: _5 U: P

( }2 f! a! c" e/ x
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
( D0 `% J7 M+ a4 t9 o

5 E$ c- v# v% V1 ~( X& E
* o7 }0 I# Y% D
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

$ W. K4 \2 ^" h* J
# }5 A, B3 H: W1 i3 s. {+ |5 C  t# q
3 c% S# ~- ], y$ N9 d8 }, r0 ~- k# E
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

" n+ {! ~& s8 \1 z" r/ @$ \
5 `4 z. B9 V" a2 y; I% b) i' a

3 D- E( F- h  @0 X9 J* e
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

- V2 N7 _: I) a3 h
: c/ i- z' X% f% m: E
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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
/ b- Q2 A( r* b9 l1 X
. G8 n; ]0 N( v5 f4 o! T5 d8 k6 C: G' Y5 r) S* T2 c% D# V
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12' Q2 t# p8 K7 W/ g- S
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
' P  l+ t. s: d: p) m
刚好微信圈有这个,就转过来了。

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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