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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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论坛元老

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楼主
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术

: _! [; k) e: k9 e7 ]$ c. v
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
% V" c) h# g  s. X" `* k/ j: d
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

; G4 }7 F$ k' c  v# y3 f- T, A0 k
——正式开始——
& ^$ S1 B4 c7 P) v
1. 折线图

$ u1 T( T; a; _3 v% @9 z6 h( \: l
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

! F( A9 t6 {- C2 W
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

6 m& g0 t0 Y8 F* {' o
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

: ]9 }" y: X9 Q& o
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

+ }: `9 J! `$ F
1 L5 S- d: r3 ?0 v

0 Z$ f& n6 d- H( L
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
& q" [6 j6 P+ v3 S" I

* @0 I$ N8 F( F! j* h5 F

* K8 D. E; u8 v& k$ @4 @
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

7 m( N3 ~8 |. G: W6 J" Z

# ]) w6 I  l5 s- _( z
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
, D; x; z* @2 K

% }( R: @* E+ \% q; V: D* u9 M
$ a+ [  P. p5 q6 Q6 S' L3 P+ _( J
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
, \6 P1 N* C9 |! e6 ^1 A8 i. i' j

, F/ @$ z, l1 m( D6 w3 r

; U  U. s8 L6 x# R; D# T
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

: I2 V; U( E0 u$ m7 R
9 ]% e4 ]1 [4 p8 r! d, U& V* N$ k
- w% T( Q% S2 |, z! e: F1 J0 P' @% d
  在Data栏中输入数据
$ e4 i9 q1 O+ g* b' w. a; M% `; j3 j

) M' R3 ^: L( \5 h' M
5 N0 T. Y3 l: g* j8 ?. U
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

( {8 G3 E) I' ?8 M4 w  R/ d

# z1 K' [, C* V; J9 C& _

: Q. i; \. \7 s" j+ p5 l
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
. d; w* U1 ~2 n( E1 `  D
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

3 v0 f3 n4 a' l: I* q
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

) v, ?& S1 a1 ]; w( `, n' ], J+ D
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

! ^& Z/ ]$ S$ l3 ]/ R

$ `* k1 B. l+ T  ?

. R, q% M4 v' l% C# C
在data栏中粘贴数据,如下图

# J" B* a0 \" p' R; P9 z& i! {
. J2 W: i: T  r4 {+ a; ?

2 Z4 ^. z* M% U  v6 b- s: \1 @
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
+ C7 j) C- ^% j$ K: ?6 K

* y. _" E  u( E$ A4 V* T
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
& v" G  L0 l$ Y  W* J
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

5 v9 B3 O* t3 L8 S
! s2 }9 N7 c$ b) V/ Q

+ C5 O2 @  {$ B$ V; Z* t
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

' v/ k: b1 E! ]2 g% m  L5 Z
$ I- w- l% L5 l( B

4 B- E+ V' }$ x
  将数据粘贴进去

4 b$ P% j8 N) \5 x6 Q

& A* P: J' ?  w

; p, n2 w7 K8 Z
  软件即时生成的图如下图所示:

! H3 X8 g8 Q! r
6 |1 H7 h* f% V% S! u

; t7 \, v! w) U4 F' }6 _
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

) Z8 P" g- w# m: Y9 j
2. 柱状图
2 e) Y3 T: N( f, x1 o
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
1 c! }7 B  p" \2 }+ Q4 E
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
5 J- U0 R2 b1 D! ?
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
8 R' t# q( Z1 E5 Z0 S9 [
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

! f6 _! \; d, z4 [9 |0 n9 y

7 |0 O  I% D& F& K* _
* a% z) g. q' u8 t2 V
在Data分栏中输入以下数据
' F5 P* _+ `, P6 d0 o& M
. T/ m! Q  d: y; w- ^3 }) S/ C4 B

* V6 w& n: _/ K4 B$ }# d' \) f+ a% B
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

% p$ C+ K0 @7 s; ^) l3 e& x

1 n& W; J, s) w* H' n
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

+ U, y, `8 W7 X$ u" E8 q# R4 l, [. n8 M
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
5 i7 ^2 ]8 s; p0 k7 q* Y! k/ o
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
4 M5 [3 l$ r+ w' c7 }( F7 P
3 t0 b; t8 L6 }7 z( A, ^( n
4 \& l+ h2 |/ I9 N7 G6 `& g1 Q' X
  在Data分栏中输入以下数据

; K" K0 y; E5 J3 U
+ t  Z9 ~! h, V+ M  t. j
3 p# @5 R( W2 H7 `1 N$ j7 J4 M0 ?
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

( N2 i% _! |$ [6 s. Q3 C
+ l: Q9 _8 [+ u' p
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
& h1 Q  j1 ~7 Z9 ^0 e, e
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

: J) R! y/ q$ S; O$ K
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

. i6 X3 r0 u- B) D
" j" V: Z! @$ W5 D: g" U

- w2 V9 ?" W3 G' Z
  软件及时生成柱状图,如下图

1 W" D2 c" M( _8 H# L7 X& _4 x

: s) F/ f/ U$ t: l9 [! l
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
  p% |" @6 B) W; e0 ?$ T5 `9 f
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

1 `3 N" [& o/ J' O
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
* H7 L$ `+ f; M
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

- l3 x% m/ x( M1 Q- N% K; }' f) i

7 c/ Y4 Y& ]) o) M1 d4 f( t& U
- A. @  C2 C+ ^& ~: A  c
在data栏中输入数据

' \. u. @% W. r$ O. N* @

$ {/ R" r" c, T9 {" m
- o% U0 f) }4 Y1 k2 q8 z' M
软件即时生成的图如下图
& _# }" Z! r- Z8 b5 Y

" U- C9 f! D- C1 Z; v; n0 @' e

/ s- N" M5 @$ ?- a% w% W% q
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

. c$ y. B7 \5 O# L+ _
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
- X6 i# G( D7 l  _0 V6 U* L
3. 组合和导出图片
, f0 K& d/ n( n
点击layout栏,出现下图所示界面
" {5 h3 [7 X8 u0 K( _! V/ m
2 u) f; D: E( u) I

/ m7 H" w( l# V5 E/ m# ]' A
9 |4 h) r  P( i" D1 C
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

" g" T5 m9 J+ N( w

7 j: q) h& |( r( R" e
! Y4 ]$ w6 ]' J! M1 ?
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

0 \! r5 e" I; W" n/ c- N2 d
+ A) Q% e  M- S- U" `

, O1 r' M0 k! r2 Y
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

6 G! X/ b9 P+ {
6 X% A+ C* V% @8 I0 d3 i
' b6 z' J* \; Y
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
0 `4 L0 |0 \0 n' U+ ^

6 @$ o+ l6 T, c# q, \( j
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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
# D. @/ m$ f+ i$ D. W+ X" V+ B: p; a5 p9 q8 C3 V9 E( L' R

- o( I" a) a$ K  \% K1 Y6 T比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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论坛元老

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地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
$ i' N. e5 ^! o( }. n" ^满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
6 h& I) q4 c& y6 z, [& N' @; W
刚好微信圈有这个,就转过来了。

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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