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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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论坛元老

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楼主
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术

# X# Y0 @4 S1 w; M( m
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

0 q7 `5 N/ H+ v" Q1 ?  O4 \; p
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

& |) z7 a/ A2 z, {' F8 U4 H7 p& W0 ^
——正式开始——

/ x" e. {9 i! p" q( t" b; X; ^
1. 折线图
, f0 m* ^( ?* q% P3 a# J
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
* p4 |; t. v* q6 I' n
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
7 K7 }% i9 s) K) ~: T! R/ c6 n
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

- _: q( W$ r/ f  A8 b& W1 k
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
- T# O/ s2 T" Q$ D7 E

5 U8 W! B/ Q% A( y) j9 O  @: B

% ^* Z! X; x* \* L, \
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

! @% D3 s: r0 l& p

. H9 s3 L. S1 l. f; E7 q

; b+ ?2 I$ ]7 f
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

5 M3 H8 w8 g. b7 v. E1 t! v* C

& s2 H! n4 m+ p1 W! T) a: J; q( n
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

) o# D# o1 E  }1 x" k  a* o/ V' o, E

( e( S0 P. Y; i/ [, n1 [! ~! \
% I5 \: d& A# g+ R$ _% I
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

( v2 h# O& {$ y
7 W. Y5 q; K0 f( h
2 B# \) L% _8 q9 [" N* I8 v* W
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
. i+ }. Z) A$ O

4 z+ O+ @& z- @) ~1 ]

+ \3 X  }8 ~7 U( n+ T  G3 _9 j
  在Data栏中输入数据
" o6 M" {" K' \6 B: Z: [: Q# C

* }- S3 P8 L9 \' t/ d% f5 s6 T, ?

4 v7 k! H7 z, |7 V9 ~  T. X3 Z
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
& ?6 t! q6 v7 S" T

0 _# ^. A+ e% P

) ~# h! p1 U. k' R5 A( k
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

) _" F7 R( Z! i/ F7 r) D1 E; X
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
! p1 k/ G2 Q0 S: x5 C
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
% K6 ~4 n4 u: J- x7 y
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
6 I: Y' m; T  Q3 p( X# v6 m
# v5 P. b* c4 T& r7 F

$ i, ?" p% q( e* c9 q% G1 w
在data栏中粘贴数据,如下图

& S9 T3 `4 ~& x& t+ J) b- n
3 b5 ?( O) P5 b. Z: f! z6 X: `

) x; v; @# j2 T8 S
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
7 Z+ _- o' x! _0 N6 v. ^. K

7 s5 O( m1 {% m) }( j
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

7 p" l% K* F" H% I) _+ R
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

  X+ k, S! G- }2 K1 l
7 G% q" L8 ]) P

3 D! q. u/ _. o
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

2 O+ V+ D# v& I' [& S) Y1 e) N
1 G# P" g& F2 D

" {% W2 l6 d! A' G+ c
  将数据粘贴进去

% ^+ ]* e1 K) b" s1 [) h
% m; W  i; J" U9 A0 E
4 T: O4 \, a0 Y+ w7 n
  软件即时生成的图如下图所示:
$ a$ m: S; U& e( H
8 j) e6 W* P: R  F2 Y) a
6 r6 o6 M8 P* Q# \* v8 Q
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
9 S# k$ e. i' d2 T% A# {
2. 柱状图

9 n+ l0 t5 j+ C! A3 _+ q
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

2 V9 Y( f4 `9 l5 A
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

: K+ Q4 X  Z3 ]8 z
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
7 y3 J8 Z( e3 M5 a- a% A( ]& W
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

: I; B) w* U6 k# @
6 l2 K, J  q" n% K; [1 I
" f: @4 _' f" I# `
在Data分栏中输入以下数据
6 \1 q5 e, A! ]9 Z
: W7 o# s6 M, t- f/ f

( U4 X, y# g9 w7 s% T0 \0 r
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

" q5 }( W( K2 N1 g  l- z- `

# ^1 k  n- E9 H% x5 e3 q7 g5 k9 J7 \9 e
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
$ y8 d& F; O# ?' l8 t$ A
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

5 J/ Q% W$ p8 X2 I# b# x% G
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
) K- r7 v' X. H2 A

2 }& E8 y8 ?7 j! A9 J, l% E. n+ f

5 }7 f' H( Z, F$ f
  在Data分栏中输入以下数据

0 |& h; n7 T: b% E& z1 n7 P
1 h- V  H" c. T& u) T
5 V" d/ K; ]; U! E& d% R( Y
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

4 {9 H2 G$ ]9 d+ D

* C' f- G; j$ ^# C
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
( ?, ]- X9 g; O+ Z
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
) t) u: t. i$ V+ @4 j* I
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
- @& h# D5 x7 ~4 I8 I0 ~6 z
8 ]! g# T4 y$ h; y

* A3 k% b- k. L' J9 B
  软件及时生成柱状图,如下图
2 v  x& _/ k: R1 E$ f9 K
" x* b# Y- v1 [8 x1 R9 b, W5 |
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

! I0 Z& l6 f7 f; n% E: A1 C" C
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
- U9 g' l/ D* F- ]$ ~2 A
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
+ i: t% v9 }2 A. l  @4 y3 t
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
2 S3 V7 u9 p; ?/ O7 Q- E
0 ^& b7 C5 i/ \% L/ G

6 W+ a0 l" A# D" b( E% r0 Q
在data栏中输入数据

6 Y( G( F6 a0 U" m7 T

* g4 {' a6 j6 m9 O& B
( I# p; F* K9 i
软件即时生成的图如下图

! \6 J' z2 R2 G( w3 A
  Q5 ^" [$ m) @" j$ g$ h5 F
# T- A6 f' }  b( o! Y
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
! k$ Z- t% q3 o2 Y' E  O
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

( H' c9 M1 P. t4 M
3. 组合和导出图片

5 I$ k) K" F, L! i9 c
点击layout栏,出现下图所示界面

6 X9 X5 Z* [0 \* G
; b* r3 @; I( v

0 I0 ^4 [# a, X/ ~+ h/ S
7 k4 J2 {( l4 @3 q  G" C
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

  c) s% O0 W, f8 p) P& c
% _4 O$ E# a. |, y: h+ R
, Q- ]# _+ d! \0 `9 [2 F( f/ W, c
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

) q" ?8 K+ G" e# C
- `+ i: A; O# U6 P, m
  H4 N! P" {% P6 Y# b: A/ q
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
! z" m; u* C% h% ]

; A2 ~/ j7 |. h, g- [2 ^# F! d: C2 {
; y- O/ N7 @, N) E2 b
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

1 A! e# E+ a* `: C% x/ J& |

4 o# \/ n' W7 z8 r
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论坛元老

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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
提示: 作者被禁止或删除 内容自动屏蔽

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地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12' y: x: s# D! e
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
) e3 H, _7 C' T* P8 w1 D
刚好微信圈有这个,就转过来了。

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病毒学院小学生

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5#
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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