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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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论坛元老

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楼主
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术
/ V) [7 d6 B/ c+ Z' u7 w* \
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
+ t- j# c' f6 ^
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
. F; p- h' t6 i1 o: p- B
——正式开始——
' x+ p. a7 U$ k1 q# c+ F7 Y
1. 折线图

, m- ~& y: `4 L$ v4 u+ c6 [, m  L
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
' `/ }9 ?6 u# X# ?7 T: L' ^1 o0 J
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

& N; j, f& s( S2 ^- ~
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

; d1 a& F3 a4 j8 Q, Z
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
  E; I% P# f+ G0 Y% I. X
9 I" k( H% {0 k/ B* s# R" c# h
$ ^8 x2 L% |: L2 m% c# P( Q3 r
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

9 z8 N. [" C. g

$ m# e: n( L+ U+ E
4 ~, f% N/ |8 ]$ f! }7 Q
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

6 C4 G% t7 q& _) z8 b& r1 B1 W! C
  o, g' I) q2 s- I
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
# i- s) ]7 H9 F

0 A% ~; u* l5 x" E, b9 }

0 X3 n) k/ w, c7 z/ ^# {$ P& u
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
8 \+ m4 ?) Q' Q
0 Q# H0 C3 b! w! O
  [& m/ N9 F: @* |. f
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
3 Y( @. a1 z$ Y) o

! o$ e' }. n1 t4 a0 l
8 ~/ ?7 a5 B/ @4 b$ u% l6 I
  在Data栏中输入数据
4 D/ G3 Z# I' Y7 }/ C+ i7 U/ o3 g
& g, l1 Z" N7 X( R/ J( D5 V+ u& A

3 P* g0 K3 y0 K: Q0 I! n3 G
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

5 v& v, X( I9 M3 a. R- L

) X  D+ v$ f: ^2 ~, T9 ^. o- x
. B7 R. O: X3 o( f5 [: B7 k
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
9 w1 L6 Q  X5 j1 a5 t1 J
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
4 O. Q2 H, w& Z4 ?9 @: O) ~
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

& E" u- J/ S# ^# v+ [/ }3 G& i
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

8 G, _; p+ O5 N9 M
( K/ p  U- @. \/ W' k" k, u

1 M0 v) w- U2 H7 f8 }6 U* B
在data栏中粘贴数据,如下图
; x8 @1 N1 m) J" F$ C

; X" ?5 p5 [! p: s8 g3 U
. ^6 `2 L' \+ B4 a
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
3 n3 p% Y5 a1 ?( M" v

, `% q2 M# ~; l+ G' H' k9 P6 B
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
! w  t( H! \  ~% Q6 W) R' P. R7 K
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

8 S3 p' N9 i/ R& F0 v- j
. W  z! }0 V( {' T# n' z4 I
* z  c7 ?9 n# y' W* ~# I7 v
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

1 |, d% n8 G# H2 R
% }! _5 }9 s+ U/ ]& Y

2 z! X: C6 f0 k" @
  将数据粘贴进去

- J+ B9 N2 W. V8 n2 J. t7 T
, y! H( I3 U% ^  _" x2 ^

- h% D) A; ?# z& }* X+ \" v# f( T) L
  软件即时生成的图如下图所示:
) S0 @2 Z( |5 v+ @- W& h. h
9 _9 |3 ?& ~- d# F7 y8 O/ v8 G

0 @1 k: s8 F" W8 A+ ?& r* s
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
3 t  @( O1 J+ `1 G4 U
2. 柱状图

- S7 ~1 X5 o6 A/ E" B
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
* h+ @0 l& K# u  O/ L! d6 d
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
' e% N2 v) W8 A0 {6 `
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
# O+ W) P5 V" ^$ l1 [( w0 {% t
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

: i  E2 P, r7 O8 ^0 g5 H  K1 b/ l

& ]6 G& l& A) S, e7 h
9 t7 f" r8 q* W, B: y- J6 C3 f
在Data分栏中输入以下数据
/ D% u4 {! x: d# g; z8 t+ L5 J

+ ^$ ?6 w7 S4 A, N8 R
, R: I( c4 i5 W. |9 P
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

4 ^# B6 ~+ [2 X; X2 }7 {2 t
1 ?: w3 E; H( ~) c9 D
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

, ], f1 |5 G) r, z6 W0 T
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

- Y8 y$ c  v( L: R  I( V
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
' J; Y, P  i( w) |9 q: r% Z3 B
5 b* `+ F7 Y( F2 G/ v; j

* o8 n4 Q5 S1 H7 O, b8 q
  在Data分栏中输入以下数据

3 C; t% H  Z+ m" A/ y9 C2 E  i
# F$ x  N# Z2 J7 i& V* Z
. B8 G4 w7 [+ ^9 C" y
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
: ?- I& s/ _9 v) Y; p+ z  l" t
: S# B& e/ f& b/ a% U  b! f* N
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

, U  p1 p1 I1 p/ Z, e: T! q
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
8 t/ K. O5 F7 R; }( |- r/ C
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
0 L1 m) M  s" s- A) f

. V. U7 j; g$ e# D

# ]0 ]# `: b- t0 K
  软件及时生成柱状图,如下图
' w0 F# A  a8 g* \, Z$ v4 z

, q8 u( [6 g/ G4 n3 y% l/ c7 Y' u
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

* W9 `6 h5 A. P5 W4 b- Y
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
4 K- M7 i% J6 b2 w0 c6 j' g' G6 v) h
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
( C- }0 O7 n) l3 f0 @8 N
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
& G1 A) ^, e% S  }: o; e

+ N% c6 t2 l3 L9 I
. U2 U1 K/ L# d2 G2 x9 H
在data栏中输入数据
9 a4 i# d7 ~0 o# |4 R

8 V  z: q( d& C" |' K: ~) i5 |. G
6 D$ O: G# Q; o
软件即时生成的图如下图

+ v: R4 q7 h; S1 ^' y! r. q) S
, Q- H, V, n" l$ n* `7 ]
( U  C' l7 }) |* N! I
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
, c$ B( W, {; {! u& `9 Z  U. E+ U% A& [
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
$ O' |8 z2 C, w, X; R
3. 组合和导出图片

0 l0 ]* i! a) h
点击layout栏,出现下图所示界面

9 k$ T) n. }, Q) [
, z$ ^: w3 ]5 V$ k8 |

& y$ f3 Q# P  v% l8 O; @6 X0 w+ w

3 J9 Q, l$ T5 i' e! `
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

* v7 X, n( w4 w3 O3 v

0 L) j" n& u& f& u5 F. O8 x

9 \0 u! v" D) q4 E0 ]9 r
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

$ ~1 R3 s) _7 m. I) o

; r& d: C2 P+ [' D8 V
4 X0 t) M+ s! A- D4 Z# k
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

; E, `# `7 o9 m' X" Z. }% E* t2 e, r

# L, O% P+ z5 L6 s( ?, Z- a

0 T6 p0 `4 I# t2 `2 K3 N
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
1 q  x! L/ S" ~
$ N- A# Q/ `3 [- H8 X
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论坛元老

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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
提示: 作者被禁止或删除 内容自动屏蔽

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论坛元老

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地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12! C5 _( H/ _! t7 T/ M
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
# I- B9 K* m' b* w! @% s% L# o
刚好微信圈有这个,就转过来了。

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病毒学院小学生

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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