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同期两篇Nature:邵峰和国外实验室同时发现炎性坏死机制

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发表于 2015-9-17 18:29:12 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式


“这是一项具有极高原创性的研究工作,揭开了在炎症领域潜伏多年的‘黑匣子’, 是炎症领域研究的重要里程碑,具有‘非凡的重要性’!”

获得国际顶级期刊《自然》杂志四位审稿人如此评价的,是伦敦当地时间9月16日下午6时(北京时间17日凌晨 1时)在该杂志在线发表的一篇长文,其内容是解析细胞炎性坏死关键分子机制,通讯作者为北京生命研究所资深研究员邵峰博士。

“这项研究成果可能是我回国十年多来最为重要的工作。”邵峰博士告诉记者,该发现不仅破解了一个极为重要的科学难题,为治疗败血症、痛风和家族性地中海热等免疫疾病提供了可能和理论指导,同时也开辟了一个全新的细胞炎性坏死研究领域。

细胞炎性坏死是一把双刃剑

既可激活人体免疫系统消灭病原体,又能导致痛风、败血症等多种免疫性疾病

据邵峰介绍,在成年人的身体里,每天大约有500-700亿个细胞死亡。这些细胞大部分是通过细胞主动“自杀”实现的。这种细胞“自杀”有助于人类去除机体内已完成正常生理功能、不再需要的细胞,控制癌细胞繁殖或其它已发生功能紊乱的细胞。同时,细胞“自杀”也是清除各种微生物病原体感染的重要手段。

“细胞‘自杀’有几种,其中非常重要的一类叫细胞炎性坏死(学名为细胞‘焦亡’)。”邵峰说,和其它类细胞“自杀”不同的是,这种细胞死亡可以激活强烈的炎症反应,外在症状包括发烧、红肿、疼痛等。

“细胞炎性坏死和发炎在人类身体对抗感染的过程中发挥着非常关键的作用。想象一下,你的细胞是一个‘小房子’,而病原体躲进了‘小房子’,在里面复制、繁殖,最终可能导致细胞和机体功能紊乱、感染性疾病的发生。在这种情况下,你最好的办法就是把‘小房子’炸开,让病原体暴露出来,同时释放信号招募、激活身体免疫系统的其它吞噬细胞,来消灭病原体。”邵峰说,细胞炎性坏死正是“炸开”被病原体入侵的细胞“小房子”并激活免疫系统的有效方法。

“但是,细胞炎性坏死也是一把双刃剑。”邵峰解释说,当人体中由于遗传突变发生不正常的细胞炎性坏死时,会导致诸如痛风和家族型地中海热等多种自身性炎症或自身免疫性疾病。同时,过度细胞炎性坏死也是细菌感染导致内毒素休克和败血症的最本质原因。“因此,了解细胞炎性坏死的分子机制,对于这些疾病的治疗非常重要。”

令邵峰感到兴奋的是,去年有研究报道表明,HIV(人类免疫缺陷病毒)感染和艾滋病的发生也和这种细胞炎性坏死密切相关。“如果这一研究被证明是正确的,那么就可能为避免HIV感染和治疗艾滋病提供新的思路。”邵峰说。

揭开20年未解之谜
通过对2.2万个基因的系统筛查,终于抓获细胞炎性坏死的“杀手”——蛋白质GSDMD

“只有在分子水平上了解细胞炎性坏死的发生过程,才能研发针对性的药物开发。”邵峰介绍说,细胞炎性坏死早在20世纪90年代就被发现,目前全球有多个顶尖实验室的科学家在努力破译细胞炎性坏死的密码,是国际生命科学领域的热门课题。令人遗憾的是,至今科学界对其发生的分子机制却知之甚少。

细胞炎性坏死是人体天然免疫系统的重要组成部分,天然免疫系统犹如整个免疫系统的触觉、听觉和视觉,用于感知进入人体的各种病原体。“在机体细胞的内部,也存在识别病原感染的触觉、听觉和视觉系统,这些系统在感知病原体侵入后,可以激活一类被称为‘半胱天冬酶’的蛋白酶(caspase)。”邵峰说,这些蛋白酶类似于蛋白质“剪刀”,其主要功能是剪切其它蛋白质。此前的研究表明,细胞炎性坏死主要由两把这样的“剪刀”完成,其中一把“剪刀”——Caspase-1早在上世纪90年代初就被科学家们发现,它接收来自天然免疫系统在感知各种不同病原体后发出的多种指令;而另一把“剪刀”——caspase-4则通过直接识别细菌内毒素分子专门负责感知病原细菌的感染,是控制内毒素休克和细菌败血症等严重疾病发生的关键因子。“20多年来科学家完全不清楚:这些‘剪刀’究竟是通过剪切什么样的蛋白质,来启动炎性坏死发生的?”

6年前,邵峰实验室开始聚焦这一国际热门领域。他带领其博士研究生石建金和博士后赵越等研究人员,在北生所转基因中心和高通量测序中心多位同仁的帮助下,通过运用最新的基因组编辑技术,对人类基因组中的近2.2万个基因进行了彻底的系统筛选,最终发现了一个在细胞炎性坏死中发挥关键作用的蛋白质GSDMD。研究表明,在细胞中去除该蛋白质,细胞便不再能发生炎性坏死。

“更重要的是,我们还发现这个蛋白就是引发细胞炎性坏死的直接‘杀手’。”邵峰告诉记者,在正常情况下,GSDMD蛋白质会被自身携带的 “枷锁”锁住,处于没有活性的休眠状态;当半胱天冬酶被激活后,就会在GSDMD蛋白质的中间区域进行特异性的剪切,去除束缚它的“枷锁”,被解放的“杀手”自己即可直接执行细胞炎性坏死——让细胞膜发生破裂而死亡。

开辟炎性坏死研究的全新领域

一方面着手药物开发,一方面继续捕捉其余“杀手”

“对于疾病治疗来说,GSDMD蛋白质这个‘杀手’却是全新的药物靶点。”邵峰介绍说,他们已经开始着手研发药物。“第一步是研制针对GSDMD蛋白质的抑制剂,然后再细化分类,针对不同疾病研发不同的药物。这个过程会比较长,最快也得5年吧。”

让邵峰他们更感到激动的,是他们惊喜地发现:“杀手”不止一个。“我们的研究表明,GSDMD属于一个被称为gasdermin的功能完全未知的蛋白家族,该家族还包括GSDMA、GSDMB、GSDMC、DFNA5、DFNB59等成员。这些类似GSDMD 的‘杀手’在接到人体天然免疫系统的其它命令后,同样能导致细胞炎性坏死。这些‘杀手’分布在人体的不同部位,都是单线联系,它们的‘上线’是谁,发出什么样的指令,针对的病原体是什么,目前都不清楚。”

“这表明我们开启了炎性坏死研究的全新方向和全新领域,还有很多未解之谜等待揭开。所以,我们在研发药物的同时,也在捕捉其他‘杀手’——更多惊喜还在后面。”邵峰告诉记者。

“这个领域的竞争相当激烈,我们必须快马加鞭。”邵峰透露说,“前几天《自然》杂志的编辑告诉我,一篇类似的文章,半个月后也会在该杂志发表。”

鉴于细胞炎性坏死在自身免疫疾病、败血症、艾滋病等疾病中的重要作用,针对GSDMD和相关蛋白作为靶点设计药物将可能有助于人们治疗这些疾病。

来源:人民网

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 楼主| 发表于 2015-9-17 18:29:58 | 只看该作者
Cleavage of GSDMD by inflammatory caspases determines pyroptotic cell death

Jianjin Shi,        Yue Zhao,        Kun Wang,        Xuyan Shi,        Yue Wang,        Huanwei Huang,        Yinghua Zhuang, Tao Cai,        Fengchao Wang        & Feng Shao

Inflammatory caspases (caspase-1, -4, -5 and -11) are critical for innate defences. Caspase-1 is activated by ligands of various canonical inflammasomes, and caspase-4, -5 and -11 directly recognize bacterial lipopolysaccharide, both of which trigger pyroptosis. Despite the crucial role in immunity and endotoxic shock, the mechanism for pyroptosis induction by inflammatory caspases is unknown. Here we identify gasdermin D (Gsdmd) by genome-wide clustered regularly interspaced palindromic repeat (CRISPR)-Cas9 nuclease screens of caspase-11- and caspase-1-mediated pyroptosis in mouse bone marrow macrophages. GSDMD-deficient cells resisted the induction of pyroptosis by cytosolic lipopolysaccharide and known canonical inflammasome ligands. Interleukin-1β release was also diminished in Gsdmd−/− cells, despite intact processing by caspase-1. Caspase-1 and caspase-4/5/11 specifically cleaved the linker between the amino-terminal gasdermin-N and carboxy-terminal gasdermin-C domains in GSDMD, which was required and sufficient for pyroptosis. The cleavage released the intramolecular inhibition on the gasdermin-N domain that showed intrinsic pyroptosis-inducing activity. Other gasdermin family members were not cleaved by inflammatory caspases but shared the autoinhibition; gain-of-function mutations in Gsdma3 that cause alopecia and skin defects disrupted the autoinhibition, allowing its gasdermin-N domain to trigger pyroptosis. These findings offer insight into inflammasome-mediated immunity/diseases and also change our understanding of pyroptosis and programmed necrosis.

http://www.nature.com/nature/jou ... ll/nature15514.html

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 楼主| 发表于 2015-9-17 18:30:30 | 只看该作者
Caspase-11 cleaves gasdermin D for non-canonical inflammasome signaling

Nobuhiko Kayagaki,        Irma B. Stowe,        Bettina L. Lee,        Karen O’Rourke,        Keith Anderson,        Søren Warming,        Trinna Cuellar,        Benjamin Haley,        Merone Roose-Girma,        Qui T. Phung,        Peter S. Liu,        Jennie R. Lill,        Hong Li,        Jiansheng Wu,        Sarah Kummerfeld,        Juan Zhang,        Wyne P. Lee, Scott J. Snipas,        Guy S. Salvesen,        Lucy X. Morris,        Linda Fitzgerald,        Yafei Zhang,        Edward M. Bertram,        Christopher C. Goodnow        & Vishva M. Dixit


Intracellular lipopolysaccharide from Gram-negative bacteria including Escherichia coli, Salmonella typhimurium, Shigella flexneri and Burkholderia thailandensis activates mouse caspase-11, causing pyroptotic cell death, interleukin-1β processing, and lethal septic shock. How caspase-11 executes these downstream signalling events is largely unknown. Here we show that gasdermin D is essential for caspase-11-dependent pyroptosis and interleukin-1β maturation. A forward genetic screen with ethyl-N-nitrosourea-mutagenized mice links Gsdmd to the intracellular lipopolysaccharide response. Macrophages from Gsdmd−/− mice generated by gene targeting also exhibit defective pyroptosis and interleukin-1β secretion induced by cytoplasmic lipopolysaccharide or Gram-negative bacteria. In addition, Gsdmd−/− mice are protected from a lethal dose of lipopolysaccharide. Mechanistically, caspase-11 cleaves gasdermin D, and the resulting amino-terminal fragment promotes both pyroptosis and NLRP3-dependent activation of caspase-1 in a cell-intrinsic manner. Our data identify gasdermin D as a critical target of caspase-11 and a key mediator of the host response against Gram-negative bacteria.

http://www.nature.com/nature/jou ... ll/nature15541.html
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