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标题: 如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图 [打印本页]
作者: 满清帝国 时间: 2015-5-13 08:52
标题: 如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图
来源：医学生学术
' w4 b# u- A0 r/ O 您还在为做统计图头痛不已吗？还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗？有没有什么解决的办法呢？
; w; m+ i0 _% t2 v
小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图，所以今天总结了几种常用统计图的做法，教您轻松快速地做出漂亮的统计图，您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
6 m7 O' V9 ^8 J+ R7 U) l: {- r
——正式开始——
( ~7 m, {% f% S/ ^5 n& b# r4 ]% Q
1. 折线图
1 e T0 a% ?) ?2 @# S! U* a 折线图最为统计图中很常见的一类图，它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据，因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值，所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图（XY graphs）。如下文实例。
5 i' j8 l' s' D: j8 V
1.1 根据Table1的1组原始数据（4个样本在4个时间点分别测得的OA值）做折线图
3 r a- E& t: W: p& o: r) j2 i | |
0. | 0.942 | 0.846 | 0.691 | 0.515 |
4. | 0.717 | 0.836 | 0.653 | 0.483 |
24. | 0.408 | 0.367 | 0.342 | 0.231 |
| | | | |
7 C% a$ \$ L/ P9 ]1 B
打开Graphpad prism 5软件，选择XY图（XY graphs），折线图图标，因为是原始数据，需要软件帮你计算均值和误差，因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少，这边的样本数是4，因此我们把样本数设为4，如下图：
, b2 x4 Y% g9 w) W8 N
& D) @$ g$ W' R' t4 J! l, f; J5 p% ]/ M
在Data分栏中将数据粘贴进去，如下图
2 Z& @' z) f; L" z! K$ H8 k6 g
% H* h: j- Y0 ?3 A
软件就会自动帮你算出均值和误差值，并做好折线图，把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后，如下图一幅漂亮的折线图就做好了，简单吧?
W A7 \8 Y1 {$ A, [0 y: Y k
7 Q& P% E1 @3 H& v3 Y1.2 根据Table2的原始数据（治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值）做折线图
' D4 {( B: Z; h- d# O7 m% Y$ C8 s
, @5 D) n$ U2 P6 N) H3 N
打开insert 菜单的New Data Table功能，加入一张新的数据表，见下图
; l7 y P% ?) M' @% h/ E
$ K- _ d4 X/ z, X- Q( E6 Z* e
仍然选择XY图（XY graphs），告诉软件样本数是4
: I/ R+ D8 R; w3 R1 B @; X' a f
/ M- z+ @' P r
2 R7 Y3 f" Q! G1 E$ C0 g6 z 在Data栏中输入数据
# p* s6 N0 x$ G
& `* M' Q$ g8 D/ Y3 x& T! u
$ c9 U! K3 o% p: S! q
软件已经自动帮你把图做好了，稍微美化后得下图：
6 r, t: `% g" v% g) v! i8 l" @3 T
b8 ~9 M! X0 a
3 ]/ ^# N2 l' \8 U1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
& A8 t( S4 R- m# A: S 如果你的数据是用其他软件（excel,origin,etc..）已经处理过的，Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作，你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了，比如你想用Table3的1组数据做折线图
' Z8 b& H/ R p3 s+ u6 Z
Table3
| |
| |
0. | 1.000 | 0.17 |
4. | 1.725 | 0.21 |
24. | 2.133 | 0.41 |
| | |
. Z0 I6 t/ a' F, b5 X9 V: p6 y, N; }新建一个数据表，仍然选择XY图（XY graphs），告诉软件你输入的是计算好的值，见下图
! d7 U$ b- d# z# V* k6 ~; A6 g9 a: {
' w! X' X' C8 A7 @3 D4 i
在data栏中粘贴数据，如下图
- o5 f* c: T2 [ B3 U) v) R
/ H" S1 F6 Y# X2 {
: _! w! g, N2 l2 u; l 打开Graphs栏目下的Data3，看到软件已经做好了图，稍微调整一下字体的大小，就可以得出下图所示的折线图了：
, }9 W$ z0 Y& B( q& a' `- h& \$ H" P" U
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
' C, D/ Y8 t! v- b
如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图，步骤和1.3的一样。
+ d9 C4 h' b# {" o5 i+ p) l9 h
) z+ {' a7 I, X4 {
' K) X, W/ g1 H+ i8 ]7 j1 D5 F+ K 仍然选择XY图（XY graphs），告诉软件你输入的是计算好的值，见下图：
2 ^" S, p6 z7 n
. S0 F5 W5 m! s' Q
+ o/ p+ G. e5 Q+ f; E* N+ o1 p3 s 将数据粘贴进去
9 w s* f. L* t. z7 q# o
( z! c- d9 J+ O1 Z9 C1 B# c
1 D. g! y" P& J* E4 G* Y8 O3 y: w) E
软件即时生成的图如下图所示：
/ U( x' `+ f2 J2 }1 T" v
1 _/ j6 _" S. y# r% R8 @- E/ p8 h: {( h5 B$ W! T( U* M! w
折线图的处理讲完了，简单吧，让我们来看看柱状图怎么做
, A* |7 X: y9 V/ r7 w
2. 柱状图
! P4 _, Q. Z& {
柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异，和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值，因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同，见下文的实例
" w4 u O! L6 P) ]9 U
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
$ [5 v, s9 x/ f# c2 c$ mTable 5
| Control A | |
Sample1 | 0.942 | 0.717 |
Sample2 | 0.846 | 0.836 |
Sample3 | 0.691 | 0.653 |
| | |
9 D9 Y" u" n# b4 c% S. R. b
选择Column graphs栏，因为该栏默认输入的都是原始数据，因此没有输入样本数的地方，只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
! f9 C8 y8 P$ d. D% r- Z- n: `
4 f. [2 U" Y: Y z3 Q$ k. K
" L2 c: @ M' N/ m$ h! y4 E
在Data分栏中输入以下数据
9 s, b5 u n/ V1 f7 N
r0 a! @. t3 l" d
9 N! i0 ^7 s) X3 @
软件就会自动帮你算出均值和误差值，并做好柱状图，见下图：
0 y! T# b# q' N6 T1 h
& w8 P+ m9 {, N ^( c2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
4 Z2 R7 l! r% M6 ^- I: f
Table 6
| Group A | |
Control | 0.942 | 0.846 | 0.691 | 0.515 | , 0.717 | 0.836 | 0.653 | 0.483 |
| | | | | | | | |
2 B8 t7 C8 P' j. d3 j# s
这次因为涉及到两组数据比较，所以我们选择grouped栏，图表类型选择柱状图，因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据，因此有输入样本数的地方，这边的样本数是4，因此我们相应地设置样本为4，见下图：
2 g5 R6 j g3 h1 Z
6 Z3 ~5 U; J. h9 p+ u
Y# R% h& @: j5 P# M% _# [
在Data分栏中输入以下数据
& D; T! ?# @) L2 Q: \. v/ P' N% t
/ Y: ^0 }0 M+ Y- ]: z) W3 ~2 F; w8 ~( L+ D
软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图，如下图。
1 v% y! S" y; P5 Q; [- s, N5 o% ^5 \
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad，现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
A: `! N! F8 v- K: O/ UTable 7
| | |
A | 1.000 | 0.17 |
B | 1.725 | 0.21 |
C | 2.133 | 0.41 |
| | |
/ a" S1 F" I0 t/ ]6 u
仍然选择Grouped栏，告诉软件你输入的值是已经计算好的，如下图
F6 N$ M1 M6 X- @. e! i# x' X7 Z
( A4 f* w$ x2 `# _( ?0 Z @0 c
. W$ f, _: I* |, ^( i" @& l 软件及时生成柱状图，如下图
/ G& q6 ~" C& @" s: \% H2 {% T) J2 O
) I; F* U1 Y( n, ^' `0 M
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
4 q5 v1 f* X0 P; O* ^, u用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
5 R) B2 Y h2 v
| Control | |
A | 1.000 | 0.17 | 3.604 | 0.31 |
B | 1.725 | 0.21 | 2.534 | 0.43 |
C | 2.133 | 0.41 | 3.381 | 0.74 |
| | | | |
! Y d1 z% t, E; p$ c
操作步骤和2.3一样，只需多输入一组数据，仍然选择Grouped栏，告诉软件你输入的值是已经计算好的，如下图
$ d( S' e3 m, e, A
2 ?6 n5 j t3 {6 v
, K+ U2 u# w7 U
在data栏中输入数据
+ j* t' o$ O7 p) ]6 w2 |
5 v- G& m* H k7 d, L/ n" M* H
7 z7 |+ G% l* U* V8 C' G* ~6 e# [9 N0 m
软件即时生成的图如下图
) X! [+ K! J: ?* a3 L" e7 u7 s! i
+ `* @- {* R7 A. D$ v, T
0 M1 Y, y6 G1 o2 \; K
折线图和柱状图的处理都讲完了，在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律：
5 x: c" _3 X4 m' K" a) w一、折线图，散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图，箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏，处理加工过的数据一般选择group栏。
3 W- X9 \. a7 L. g3 {3. 组合和导出图片
, K3 e) n" Q ]7 S) G
点击layout栏，出现下图所示界面
0 V2 [2 r8 N3 r4 U
% Y! [* }% ~) z I8 P
/ p; p( Q3 N* }
根据你的图片的数量，选择合适的布局，下图选择的是6张图分成3排排列
, V& q$ K4 T% x7 F$ \9 h
3 B# a/ d4 H2 x B9 s2 M! g4 v, j0 d# b
将做好的图片拖到对应的方格中，用添加文章工具加入图片编号，完成后如下图所示
3 Z" X. s. ]/ S* X8 U5 R' Z! T8 B
5 M3 \! C0 S t, S# n! z6 E0 X" [
4 c$ C, }4 s B3 B* ?$ B
然后导出图片：点击File目录下的Export，出现下图所示的界面，选择好符合相关SCI杂志要求的格式，分辨率和宽度，如下图
s+ V* `# w& e$ `( _6 N* @% k7 \
$ D" n& Y! m6 h/ N2 C o* g- g
I4 c5 P/ B# h A1 |& q; D 点击ok，一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了，见下图
# ?8 L6 O7 ]" w/ V) u- @) `
5 s# w/ G6 }/ Q3 E4 w; k T/ w
作者: 满清帝国 时间: 2015-5-13 08:55
补充，对于样本量少于5的Groups图，不建议做柱状图，而应该做散点图。
作者: walkundersky 时间: 2015-5-13 09:12
提示: 作者被禁止或删除 内容自动屏蔽
作者: 满清帝国 时间: 2015-5-13 09:25
$ U6 c, v" z. y% v
刚好微信圈有这个，就转过来了。
作者: qupanke 时间: 2015-5-13 17:01
很棒的软件啊！表示喜欢！
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