hantavirus 发表于 2015-6-2 13:57:43

[转移贴]小试MEGA 4.1建树(应该适合新手们的)

原贴由kousyouki 发表于发表于 2009-3-8 16:18

前些天试了下MEGA 4.1,并练了下,现在贴出与众友们讨论讨论。由于水平有限,若有错误的地方,还望兄弟姐妹们跟帖指出呀~~~

参考资料:1 MEGA 4部分中文手册(实例)
          http://biosky.haotui.com/images/attachicons/msoffice.gif 分子进化树构建及数据分析的简介.doc (73.5 KB)
分子进化树构建及数据分析的简介
          http://biosky.haotui.com/images/attachicons/msoffice.gif Clustalx的使用.doc (221.5 KB)
Clustalx的使用
          http://biosky.haotui.com/images/attachicons/msoffice.gif 用MEGA作进化树.doc (188 KB)
用MEGA作进化树
          clustalx(多序列比对、分析)使用说明书http://bbs.virology.com.cn/viewthread.php?tid=362&extra=&page=2
                  等等.........



这是我做的东东: 5 MEGA建树步骤kousyouki

“进化树”搜索结果:
   http://images.haotui.com/dz7/default/attachimg.gif http://imga1.haotui.com/userdirs/2/a/biosky/attachments/month_0903/20090308_175d57175b8b389a44ebT5e0iIisSZf0.jpg


以下是我搜索毒坛里关于进化树的帖子,贴出方便坛友查看:
1.分子进化树构建及数据分析的简介(入门极品)http://bbs.virology.com.cn/viewthread.php?tid=313&highlight=%BD%F8%BB%AF%CA%F7
2.生物信息学精讲——进化树 http://bbs.virology.com.cn/viewthread.php?tid=6854&highlight=%BD%F8%BB%AF%CA%F7
3.一篇简单顶级文献---讲述入门进化树分析 http://bbs.virology.com.cn/viewthread.php?tid=74&highlight=%BD%F8%BB%AF%CA%F7   (确实很好)
4.用MEGA2做进化树的步骤 http://bbs.virology.com.cn/viewthread.php?tid=361&highlight=%BD%F8%BB%AF%CA%F7
.....(其它的请坛友们补充吧~)


发现有两个怎么传不上,原来是超出512kb了~~~补传:

MEGA 4部分中文手册(实例): http://kousyouki.qupan.com/2384115.html

这个是我做的,MEGA建树步骤: http://kousyouki.qupan.com/2384206.html

再传一篇文章,不过这篇文章分析那里有点错误的地方:
http://biosky.haotui.com/images/attachicons/pdf.gif 中国丙型肝炎病毒基因型的进化树分析.pdf (175.77 KB)
下载次数: 118
2009-3-8 16:48

中国丙型肝炎病毒基因型的进化树分析

希望坛子里热心的朋友们补充和分享各个软件的学习经验、点滴经历和进化树的分析过程~~:shutup:

   ~\(≧▽≦)/~

[ 本帖最后由 kousyouki 于 2009-3-8 16:53 编辑 ]


hantavirus 发表于 2015-6-2 13:58:52

备注:原始贴里面的很多链接,现在已失效,先转过来,期待高手慢慢补充更新。

序道 发表于 2016-5-21 13:16:33

现在版本都已经7.0了,不过还是6.06好用
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